- 2022 - 2028 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム
- 2022 - 2028 生命科学連携推進協議会
- 2016 - 2021 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム
- 2019 - 2020 専門書「冥王代生命学」の出版
- 2015 - 2020 冥王代生命学の国際研究ネットワーク展開
- 2014 - 2019 冥王代類似環境微生物
- 2014 - 2019 冥王代生命学の創成
- 2014 - 2019 冥王代生命学の創成
- 2015 - 2018 腸管IgA抗体による腸内細菌選別機構の解明
- 2013 - 2016 芳香族系汚染物質添加環境での微生物集団応答様式の包括的研究
- 2013 - 2016 水田メタゲノミクス:持続的生産を支える土壌-根圏微生物とその機能の全貌解明
- 2010 - 2016 ゲノム科学の総合的推進に向けた大規模ゲノム情報生産・高度情報解析支援
- 2013 - 2015 ヒト第二のゲノムである常在細菌叢の「記憶」と「老化」の制御と再構築
- 2011 - 2014 核様体タンパク質結合部位解析に基づく染色体多様化機構の解明
- 2010 - 2012 高解像度細菌叢解析による口腔微生物環境の恒常性維持メカニズムの解明
- 2010 - 2012 環境汚染物質添加土壌での微生物集団応答様式の研究
- 2008 - 2010 新世代DNA塩基配列決定技術を用いた大腸菌pan-genomeの解明
- 2008 - 2010 ChIP-chipによる3種の大腸菌を用いた転写因子結合部位の多様性の解析
- 2005 - 2009 共生、相互作用など複雑なゲノム構成系を解析するための情報基盤研究
- 2006 - 2007 腸管の粘膜表層に常在する細菌群のゲノム解析
- 2005 - 2006 病原細菌におけるIII型分泌装置のエフェクター蛋白質の情報解析的予測
- 2004 - 2004 病原遺伝子データベースの構築およびゲノム全遺伝子の相互比較による相関解析
- 2003 - 2003 病原性データベースの構築およびゲノム全遺伝子の相互比較による相関解析
- 2002 - 2003 大腸菌O157の病原遺伝子発現における外来性tRNA遺伝子の役割
- Metagenomics
- メタゲノミクス
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