- 2023 - 2026 アフリカ三大古代湖におけるシクリッド科魚類の適応放散を駆動した摂餌形態と機能
- 2023 - 2026 地球温暖化下でサンゴ礁生態系のレジリエンスになわばり性藻食スズメダイが果たす役割
- 2020 - 2023 地球温暖化下のサンゴ礁の復元力になわばり性藻食スズメダイが果たす役割
- 2018 - 2023 環境収容力推定手法開発事業・ウナギ課題
- 2018 - 2022 アフリカの二つの古代湖におけるシクリッド科魚類の摂食戦略の多様化と多種共存機構
- 2020 - 2022 クルマエビ類に寄生するエビヤドリムシ科甲殻類の起源と特異性、及び宿主の免疫反応
- 2017 - 2020 サンゴ群集の大規模白化からの再生になわばり性藻食スズメダイが果たす役割
- 2015 - 2020 植物食の起源とその多様な展開
- 2016 - 2019 インドネシアの金鉱山地域における水銀汚染リスクの低減に関する超学際的研究
- 2015 - 2018 左右性行動獲得の生態学的研究
- 2016 - 2017 愛媛県内のコイヘルペスウイルス病発生のメカニズム解明と予防法の開発
- 2013 - 2016 スズメダイの藻類栽培における多様性と地理的変異、それらの多種共存に果たす役割
- 2010 - 2012 脊椎動物の共同繁殖のモデルシステムとしてのタンガニイカ湖魚類の繁殖と社会性の解明
- 2010 - 2012 藻食魚と藻類との種特異性と栽培共生:水域の「植物-植食者」種間ネットワークの解明
- 2008 - 2009 藻食魚と藻類との栽培共生:水域における植物-植食者相互作用系の種レベルでの解明
- 2005 - 2007 なわばり性藻食魚とその食藻との相利共生:魚類による栽培の起源と進化
- 2003 - 2004 藻食魚クロソラスズメダイとそのなわばり内に純群落を形成する藻類との相利共生
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