- 2020 - 2023 ミニマルセルの創成を通してみる生命誕生のための非平衡熱力学条件
- 2016 - 2020 細胞運動の動力学ダイナミクスの分子・遺伝子発現シミュレーションによる理解
- 2015 - 2020 ソフトマターの機能発現によるベシクルの形状変化:単細胞生物の運動理解へ
- 2016 - 2019 ベシクルからプロトセルへの道:代謝・情報・熱力学
- 2013 - 2016 分子集合体からプロトセルへの物理
- 2012 - 2016 高分子の結晶化と分子認識:普遍性と個性に基づいた第一原理材料設計
- 2012 - 2015 生体系の機能発現による秩序構造の形成と変化
- 2010 - 2014 ベシクル変形と化学場の結合:生命誕生へのソフトマターからのアプローチ
- 2008 - 2010 らせん高分子の構造形成における分子認識-新たな計算スキームを目指して-
- 2007 - 2009 多成分ベシクルの形態形成ダイナミクス
- 2007 - 2009 シクロデキストリンによる包接現象及び分子認識に関する分子シミュレーション
- 2006 - 2007 らせん高分子の自己組織化における分子認識機構の計算科学
- 2004 - 2005 高分子の構造発現における分子認識過程の計算科学
- 2003 - 2005 生体系モデルとしてのソフトマター複合系の秩序形成
- 2002 - 2004 ソフトマテリアル系の秩序構造形成:炭化水素鎖の構造形成とその役割
- 2000 - 2002 高分子鎖のモレキュラーダイナミクス-高次構造の第一原理設計を目指して-
- 1998 - 1998 タンパク質物性のマルチカノニカルMC法による研究
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