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J-GLOBAL ID：200902201144057519   整理番号：08A0617567

胚性幹細胞における外部情報伝達経路のコア転写ネットワークとの統合

Integration of External Signaling Pathways with the Core Transcriptional Network in Embryonic Stem Cells

著者 (29件)： CHEN Xi (Gene Regulation Lab., Genome Inst. of Singapore, Singapore 138672) ,  CHEN Xi (Dep. of Biological Sciences, National Univ. of Singapore, Singapore 117543) ,  XU Han (Computational and Mathematical Biology, Genome Inst. of Singapore, Singapore 138672) ,  YUAN Ping (Gene Regulation Lab., Genome Inst. of Singapore, Singapore 138672) ,  FANG Fang (Gene Regulation Lab., Genome Inst. of Singapore, Singapore 138672) ,  FANG Fang (Dep. of Biological Sciences, National Univ. of Singapore, Singapore 117543) ,  HUSS Mikael (Computational and Systems Biology Group, Genome Inst. of Singapore, Singapore 138672) ,  VEGA Vinsensius B. (Computational and Mathematical Biology, Genome Inst. of Singapore, Singapore 138672) ,  WONG Eleanor (Genome Technol. and Biology Group, Genome Inst. of Singapore, Singapore 138672) ,  ORLOV Yuriy L. (Computational and Systems Biology Group, Genome Inst. of Singapore, Singapore 138672) ,  ZHANG Weiwei (Gene Regulation Lab., Genome Inst. of Singapore, Singapore 138672) ,  ZHANG Weiwei (Dep. of Biological Sciences, National Univ. of Singapore, Singapore 117543) ,  JIANG Jianming (Gene Regulation Lab., Genome Inst. of Singapore, Singapore 138672) ,  JIANG Jianming (Dep. of Biological Sciences, National Univ. of Singapore, Singapore 117543) ,  LOH Yuin-han (Gene Regulation Lab., Genome Inst. of Singapore, Singapore 138672) ,  LOH Yuin-han (Dep. of Biological Sciences, National Univ. of Singapore, Singapore 117543) ,  YEO Hock Chuan (Computational and Systems Biology Group, Genome Inst. of Singapore, Singapore 138672) ,  YEO Zhen Xuan (Computational and Systems Biology Group, Genome Inst. of Singapore, Singapore 138672) ,  NARANG Vipin (Computational and Mathematical Biology, Genome Inst. of Singapore, Singapore 138672) ,  GOVINDARAJAN Kunde Ramamoorthy (Computational and Mathematical Biology, Genome Inst. of Singapore, Singapore 138672) ,  LEONG Bernard (Computational and Mathematical Biology, Genome Inst. of Singapore, Singapore 138672) ,  SHAHAB Atif (Computational and Mathematical Biology, Genome Inst. of Singapore, Singapore 138672) ,  RUAN Yijun (Genome Technol. and Biology Group, Genome Inst. of Singapore, Singapore 138672) ,  BOURQUE Guillaume (Computational and Mathematical Biology, Genome Inst. of Singapore, Singapore 138672) ,  SUNG Wing-kin (Computational and Mathematical Biology, Genome Inst. of Singapore, Singapore 138672) ,  CLARKE Neil D. (Computational and Systems Biology Group, Genome Inst. of Singapore, Singapore 138672) ,  WEI Chia-lin (Genome Technol. and Biology Group, Genome Inst. of Singapore, Singapore 138672) ,  NG Huck-hui (Gene Regulation Lab., Genome Inst. of Singapore, Singapore 138672) ,  NG Huck-hui (Dep. of Biological Sciences, National Univ. of Singapore, Singapore 117543)
資料名： Cell (Cambridge, Mass.)  (Cell (Cambridge, Mass.))
巻： 133  号： 6  ページ： 1106-1117  発行年： 2008年06月13日 
JST資料番号： A0707B  ISSN： 0092-8674  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 転写因子(TF)およびその標的との特異的相互作用は遺伝子発現プログラムの特異化に極めて重要である。胚性幹(ES)細胞における転写調節ネットワークに関する洞察を得るため,我々は13の配列特異的TF(Nanog,Oct4,STAT3,Smad1,Sox2,Zfx,c-Myc,n-Myc,Klf4,Esrrb,Tcfcp2l1,E2f1およびCTCF)ならびに2つの転写調節因子(p300およびSuz12)の位置をマップする上で超ハイスループットDNA塩基配列決定法(ChIP-seq)と組み合わせたクロマチン免疫沈降法を用いた。これら因子はES細胞の生物学において,LIF及びBMP情報伝達経路の成分,自己複製調節因子,および主要リプログラミング因子として異なる役割を果たすことが知られる。我々の研究から情報伝達経路のES細胞特異的転写回路への統合に関する洞察が得られる。興味深いことに,我々は異なるTFに広範囲にターゲットされる特異的なゲノム領域を見出す。まとめると,TF結合部位の網羅的マッピングにより,ES細胞同一性を定義付ける転写調節ネットワークの重要な特徴が同定される。Copyright 2008 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： ES細胞 ,  転写【遺伝】 ,  転写因子 ,  免疫沈降反応 ,  解析 ,  遺伝学実験技術 ,  結合部位 ,  PCR法 ,  培養細胞 ,  *転写調節 ,  クロマチン免疫沈降反応 ,  DNA解析 ,  *シグナル伝達 ,  *遺伝子発現調整 ,  バイオアッセイ ,  イムノアッセイ ,  *遺伝
準シソーラス用語： *細胞情報伝達 ,  *遺伝的調節

分類 (2件)： 細胞生理一般  (EF02010S) ,  生物学的機能  (EB03040U)

タイトルに関連する用語 (5件)： 胚性幹細胞 ,  情報伝達経路 ,  コア ,  転写ネットワーク ,  統合