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J-GLOBAL ID：200902201884315066   整理番号：08A0871760

「Candidatus Phytoplasma」の候補種の解像能改善のためのsecA及び23S rRNA遺伝子配列の解析に基づくフィトプラズマ系統解析

Phytoplasma phylogenetics based on analysis of secA and 23S rRNA gene sequences for improved resolution of candidate species of ‘Candidatus Phytoplasma’

著者 (5件)： HODGETTS Jennifer (Univ. Nottingham, Loughborough, GBR) ,  BOONHAM Neil (Central Sci. Lab., York, GBR) ,  MUMFORD Rick (Central Sci. Lab., York, GBR) ,  HARRISON Nigel (Univ. Florida, FL, USA) ,  DICKINSON Matthew (Univ. Nottingham, Loughborough, GBR)
資料名： International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology  (International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology)
巻： 58  号： 8  ページ： 1826-1837  発行年： 2008年08月 
JST資料番号： D0438B  ISSN： 1466-5026  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： フィトプラズマはin vitroで培養不能な細胞壁を欠いた細菌である。この研究において,試験した全てのフィトプラズマのsecA遺伝子の482/488bp領域を増幅する一連の普遍的プライマーを同定した。これらのフィトプラズマは13の主要16Srグループの内12のフィトプラズマを含んだ。SecA蛋白質の160-162アミノ酸領域をコードするこのDNAの系統発生解析により,先の分類系を確認及び整理統合したが,さらに分離した長い分岐型のグループとサブグループ間の解像能を改善した。特に,この解析は16SrIV CLY型植物病を少なくとも3つの異なる候補種に分離するとの提案を支持し,16SrIIグループは「仮のフィトプラズマ」内の少なくとも2つの候補種に分けられた。さらに,secA PCR産物の制限酵素分解後の推定サイズに基づいて,感染植物の菌株を診断し,同定するための解析系にこれらのプライマー及びこのPCR産物のRFLP解析を展開することができるだろう。

シソーラス用語： *生物分類 ,  ケモタキソノミー ,  rRNA ,  グラム陰性菌 ,  *植物病原菌 ,  ヌクレオチド配列 ,  膜タンパク質 ,  アミノ酸配列 ,  プライマー【遺伝】 ,  遺伝子 ,  DNA【核酸】 ,  系統発生 ,  系統樹 ,  *モリクテス綱
準シソーラス用語： *ミコプラズマ ,  23S rRNA ,  secA遺伝子 ,  SecA蛋白質 ,  *フィトプラズマ

分類 (2件)： 微生物形態学・分類学  (EG03030Y) ,  細菌による植物病害  (FC04053P)

タイトルに関連する用語 (8件)： Candidatus ,  Phytoplasma ,  解像能 ,  SecA ,  rRNA遺伝子 ,  解析 ,  フィトプラズマ ,  系統解析