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J-GLOBAL ID：200902203558398647   整理番号：08A0089436

生化学的に興味ある化合物の同定にOPLSクラスモデルを用いるGC/TOF-MSに基づくメタボロミクスデータの可視化

Visualization of GC/TOF-MS-Based Metabolomics Data for Identification of Biochemically Interesting Compounds Using OPLS Class Models

著者 (10件)： TRYGG Johan (Umea Univ., Umea, SWE) ,  JOHANSSON Erik (Umetrics , Umea, SWE) ,  SJOESTROEM Lina (Umea Univ., Umea, SWE) ,  MELLEROWICZ Ewa J (Swedish Univ. Agricultural Sci., Umea, SWE) ,  EDLUND Ulf (Umea Univ., Umea, SWE) ,  SHOCKCOR John P (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  GOTTFRIES Johan (Umea Univ., Umea, SWE) ,  MORITZ Thomas (Swedish Univ. Agricultural Sci., Umea, SWE) ,  WIKLUND Susanne (Umea Univ., Umea, SWE) ,  GOTTFRIES Johan (AstraZeneca R&D, Moelndal, SWE)
資料名： Analytical Chemistry  (Analytical Chemistry)
巻： 80  号： 1  ページ： 115-122  発行年： 2008年01月01日 
JST資料番号： A0395A  ISSN： 0003-2700  CODEN： ANCHAM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： PttPME1遺伝子の発現に関して上方制御及び下方制御された遺伝子組み換えポプラ植物に見出される統計的かつ生化学的に重要な化合物の意味づけに,直交最小二乗法(OPLS)モデルに基づく方法を適用した。この方法にはS-プロット及びこれを拡張したSUS-プロットと称する二つのキーとなるプロットが含まれ,これらのプロットは,複雑なデータ構造の解釈を向上させた。OPLSを用いることにより,興味ある代謝産物の可視化と識別が改善されることを示した。

シソーラス用語： *解析 ,  *データ解析 ,  最小二乗法 ,  GC-MS分析 ,  飛行時間法 ,  トランスジェニック植物 ,  *代謝産物 ,  可視化 ,  認識 ,  多変量解析 ,  同定 ,  *メタボロミクス ,  生物
準シソーラス用語： 遺伝子組み換え植物 ,  識別

分類 (2件)： 分析化学一般  (CC02010H) ,  有機化合物の物理分析  (CC03034A)

タイトルに関連する用語 (8件)： 生化学 ,  興味 ,  同定 ,  クラス ,  モデル ,  GC ,  TOF-MS ,  可視化