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J-GLOBAL ID：200902208000235727   整理番号：09A0791922

USDAイネ遺伝子バンクから開発されたミニコア部分集合の遺伝的評価

Genetic Assessment of a Mini-Core Subset Developed from the USDA Rice Genebank

著者 (7件)： AGRAMA H. A. (Univ. of Arkansas, AR) ,  YAN WenGui (Univ. of Arkansas, AR) ,  LEE Fleet (Univ. of Arkansas, AR) ,  FJELLSTROM Robert (Univ. of Arkansas, AR) ,  CHEN Ming-Hsuan (Univ. of Arkansas, AR) ,  JIA Melissa (Univ. of Arkansas, AR) ,  MCCLUNG Anna (Univ. of Arkansas, AR)
資料名： Crop Science  (Crop Science)
巻： 49  号： 4  ページ： 1336-1346  発行年： 2009年07月 
JST資料番号： B0591A  ISSN： 0011-183X  CODEN： CRPSAY  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： コアコレクションの開発は,大きな生殖質コレクションを特徴づける手段として有効である。また,ミニコアのサブサンプリング戦略は,詳細な表現型や分子レベルでの遺伝的多様性解析の有効性を高める。本報では,USDA-ARSコメ生殖質コレクションの1794コアエントリーから誘導された217エントリーを含むミニコア部分集合を作成した。ミニコアは,26個の表現型形質と70個の分子マーカに基づき,PowerCoreソフトウェアを用いて作成された。ミニコアの217エントリーは,15の地理的領域にわたって同じような分布を示した。コアコレクション中の70種のマーカにより同定された962個の対立遺伝子は,ミニコア中に取り込まれた。本研究で作成したミニコアは,コメのUSDAコアコレクションと全USDA-ARSコメ生殖質を表現する適切かつ代表的な部分集合であると考える。

シソーラス用語： 米国農務省 ,  データベース ,  *遺伝子 ,  部分集合 ,  変異 ,  表現型 ,  バイオマーカー ,  ソフトウェア ,  *イネ
準シソーラス用語： USDA【米国】 ,  遺伝子データベース ,  遺伝的多様性 ,  分子マーカー

分類 (3件)： 稲作  (FC03020C) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  作物の品種  (FC02020V)

タイトルに関連する用語 (7件)： USDA ,  イネ ,  遺伝子バンク ,  開発 ,  コア ,  部分集合 ,  遺伝的評価