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J-GLOBAL ID：200902209412941940   整理番号：08A1107993

ヒトゲノムの溶質輸送体(SLC)相補体:系統発生学的分類は四つの主要ファミリを明らかにする

The solute carrier (SLC) complement of the human genome: Phylogenetic classification reveals four major families

著者 (5件)： FREDRIKSSON Robert (Dep. of Neuroscience, Unit of Functional Pharmacology, Uppsala Univ., BMC, Uppsala SE 75124, SWE) ,  NORDSTROEM Karl J.V. (Dep. of Neuroscience, Unit of Functional Pharmacology, Uppsala Univ., BMC, Uppsala SE 75124, SWE) ,  STEPHANSSON Olga (Dep. of Neuroscience, Unit of Functional Pharmacology, Uppsala Univ., BMC, Uppsala SE 75124, SWE) ,  HAEGGLUND Maria G.A. (Dep. of Neuroscience, Unit of Functional Pharmacology, Uppsala Univ., BMC, Uppsala SE 75124, SWE) ,  SCHIOETH Helgi B. (Dep. of Neuroscience, Unit of Functional Pharmacology, Uppsala Univ., BMC, Uppsala SE 75124, SWE)
資料名： FEBS Letters  (FEBS Letters)
巻： 582  号： 27  ページ： 3811-3816  発行年： 2008年11月12日 
JST資料番号： D0575A  ISSN： 0014-5793  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 溶質輸送体(SLC)は,他の基質の間の無機イオン,アミノ酸,神経伝達物質,糖,プリン及び脂肪酸を含む輸送体の最大のグループである。隠れMarkovモデル(HMM)を用いてヒトゲノムの完全な集合を調べ,合計384の特異なSLC配列を得た。全SLCファミリーの詳細なクラスタ化及び系統発生分析により,15個のファミリーが最大8個のSLCファミリーを含む四つの大きな系統発生的クラスターに配置することを示し,SLCの個々のファミリーの多くが共通の進化的起源をもつことを示唆した。この研究から,大きな配列セットを提供するSLCの最初の全体的ゲノム道路地図を提示し,膜蛋白質の2番目に大きなグループのファミリー間の関係を明らかにした。Copyright 2008 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： 生体輸送 ,  *膜タンパク質 ,  ヒト ,  ゲノム ,  *系統発生 ,  系統樹 ,  アミノ酸配列 ,  分子進化 ,  隠れMarkovモデル
準シソーラス用語： *溶質輸送体

分類 (2件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  進化論一般  (EC03010Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： ヒトゲノム ,  溶質 ,  輸送体 ,  SLC ,  相補体 ,  系統発生学 ,  分類