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J-GLOBAL ID：200902211910722177   整理番号：09A0152306

バイオインフォマティクス強化ツール:広範な遺伝子リストの包括的機能分析への道

Bioinformatics enrichment tools: paths toward the comprehensive functional analysis of large gene lists

著者 (3件)： HUANG Da Wei (National Cancer Inst. at Frederick, MD, USA) ,  SHERMAN Brad T. (National Cancer Inst. at Frederick, MD, USA) ,  LEMPICKI Richard A. (National Cancer Inst. at Frederick, MD, USA)
資料名： Nucleic Acids Research  (Nucleic Acids Research)
巻： 37  号： 1  ページ： 1-13  発行年： 2009年 
JST資料番号： D0242C  ISSN： 0305-1048  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ほとんどの場合,新興ハイスループットゲノム,プロテオミクス,バイオインフォマティクス走査アプローチから得られる,広範な遺伝子リストの機能分析は,なお挑戦的かつ困難な仕事である。遺伝子アノテーション強化解析は,有望なハイスループット戦略であり,研究者の最も関心のある生物学的過程が同定される可能性を高める。この総説では,約68の現在入手可能なバイオインフォマティクス強化ツールが集められている。アルゴリズムによって,68のツールが3クラスに分類される:特異強化解析(SEA),遺伝子セット強化解析(GSEA),モジュール強化解析(MEA)。従って,ツールごとに検索する代わりに,カテゴリー論理に従って68ツールの重要な精神を,容易に早く把握することが可能である。この分野に関連する,幾つかの重要であるが,ほとんど未解決な問題と課題に焦点を当てる。

シソーラス用語： *情報科学 ,  生物学 ,  データベース ,  アノテーション ,  アルゴリズム ,  統計解析 ,  検索 ,  *遺伝子 ,  機能 ,  集合 ,  プロテオミクス ,  p値 ,  データセット ,  *バイオインフォマティクス ,  *人文科学
準シソーラス用語： ハイスループット

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (7件)： バイオインフォマティクス ,  強化 ,  ツール ,  遺伝子 ,  リスト ,  機能分析 ,  道