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J-GLOBAL ID：200902232695636385   整理番号：08A0195878

生化学反応系の確率論シミュレーションのためのアルゴリズム及びソフトウェア

Algorithms and Software for Stochastic Simulation of Biochemical Reacting Systems

著者 (4件)： LI Hong (Univ. California Santa Barbara, California) ,  CAO Yang (Virginia Tech, Virginia) ,  PETZOLD Linda R. (Univ. California Santa Barbara, California) ,  GILLESPIE Daniel T. (Dan T. Gillespie Consulting, California)
資料名： Biotechnology Progress  (Biotechnology Progress)
巻： 24  号： 1  ページ： 56-61  発行年： 2008年01月 
JST資料番号： A0966B  ISSN： 8756-7938  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 生化学反応ネットワークの個別の確率的及び多重シミュレーションのためのアルゴリズムに関する最近の研究ついて述べ,StochKitソフトウェアツーツキットを紹介した。また,基本的確率シミュレーションアルゴリズム(SSA)をスピードアップするためのSSA改良又は並行計算及び目的特異的ハードウェアの使用と個別の確率的及び多重計算を加速するための近似解法について解説した。StochKitを解説し,その使用例からStochKitが生化学反応系の確率論シミュレーションに有用であることを検証し,その将来計画について考察した。

シソーラス用語： *計算機シミュレーション ,  計算機アルゴリズム ,  ソフトウェア ,  *アルゴリズム ,  改良 ,  ハードウェア ,  マルチコンピュータシステム ,  近似法 ,  生化学系モデル ,  *生化学
準シソーラス用語： StochKit ,  *確率アルゴリズム ,  近似解法 ,  多重計算機システム

分類 (2件)： 生物物理学一般  (EA02020O) ,  生化学一般  (EB01000O)

タイトルに関連する用語 (5件)： 化学反応系 ,  確率論 ,  シミュレーション ,  アルゴリズム ,  ソフトウェア