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J-GLOBAL ID：200902236526928887   整理番号：08A0759756

DBD-Hunter:知見-基盤性DNA-蛋白質相互作用予測法

DBD-Hunter: a knowledge-based method for the prediction of DNA-protein interactions

著者 (2件)： GAO Mu (Georgia Inst. of Technol., GA, USA) ,  SKOLNICK Jeffrey (Georgia Inst. of Technol., GA, USA)
資料名： Nucleic Acids Research  (Nucleic Acids Research)
巻： 36  号： 12  ページ： 3978-3992  発行年： 2008年 
JST資料番号： D0242C  ISSN： 0305-1048  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： DNA結合蛋白質およびその結合部位を同定するためのプログラム’DBD-Hunter’を新たに開発した。このプログラムは,構造比較と統計的可能性の評価を組み合わせることによってDNA塩基対と蛋白質残基間の相互作用を解析する。更に,このDBD-HunterはDNAの蛋白質結合能を正確に予測する方法で,該当する鋳型からDNA結合蛋白質残基を確実に予測することができる。約4000種類の蛋白質をテストした結果,98%確度・84%精度を示し,従来の方法よりも優れていた。このDBD-Hunterを約1700個の構造標的に応用し,今まで機能未知であった37個の標的がDNA結合蛋白質であることを予測できた。DBP-Hunterは,http://cssb.biology.gatech.edu/上で無料利用できる。

シソーラス用語： *分子間相互作用 ,  タンパク質 ,  DNA【核酸】 ,  計算機プログラム ,  *予測技法 ,  *DNA結合タンパク質 ,  鋳型【遺伝】 ,  精度 ,  最適化 ,  統計解析 ,  配座転移
準シソーラス用語： 立体配座変化

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (4件)： DBD ,  基盤 ,  蛋白質相互作用 ,  予測法