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J-GLOBAL ID：200902241991426379   整理番号：09A1123477

長距離相互作用の包括的マッピングでヒトゲノムの折りたたみ原理が明らかになった

Comprehensive Mapping of Long-Range Interactions Reveals Folding Principles of the Human Genome

著者 (27件)： LIEBERMAN-AIDEN Erez (Broad Inst., Harvard and Massachusetts Inst. Technol. (MIT), MA, USA) ,  LIEBERMAN-AIDEN Erez (MIT, MA, USA) ,  LIEBERMAN-AIDEN Erez (Harvard Univ., MA, USA) ,  VAN BERKUM Nynke L. (Univ. Massachusetts Medical School, MA, USA) ,  WILLIAMS Louise (Broad Inst., Harvard and Massachusetts Inst. Technol. (MIT), MA, USA) ,  IMAKAEV Maxim (MIT, MA, USA) ,  RAGOCZY Tobias (Fred Hutchinson Cancer Res. Center, WA, USA) ,  RAGOCZY Tobias (Univ. Washington School of Medicine, WA, USA) ,  TELLING Agnes (Fred Hutchinson Cancer Res. Center, WA, USA) ,  TELLING Agnes (Univ. Washington School of Medicine, WA, USA) ,  AMIT Ido (Broad Inst., Harvard and Massachusetts Inst. Technol. (MIT), MA, USA) ,  LAJOIE Bryan R. (Univ. Massachusetts Medical School, MA, USA) ,  SABO Peter J. (Univ. Washington, WA, USA) ,  DORSCHNER Michael O. (Univ. Washington, WA, USA) ,  SANDSTROM Richard (Univ. Washington, WA, USA) ,  BERNSTEIN Bradley (Broad Inst., Harvard and Massachusetts Inst. Technol. (MIT), MA, USA) ,  BERNSTEIN Bradley (Harvard Medical School, MA, USA) ,  BENDER M. A. (Univ. Washington, WA, USA) ,  GROUDINE Mark (Fred Hutchinson Cancer Res. Center, WA, USA) ,  GROUDINE Mark (Univ. Washington School of Medicine, WA, USA) ,  GNIRKE Andreas (Broad Inst., Harvard and Massachusetts Inst. Technol. (MIT), MA, USA) ,  STAMATOYANNOPOULOS John (Univ. Washington, WA, USA) ,  MIRNY Leonid A. (MIT, MA, USA) ,  LANDER Eric S. (Broad Inst., Harvard and Massachusetts Inst. Technol. (MIT), MA, USA) ,  LANDER Eric S. (MIT, MA, USA) ,  LANDER Eric S. (Harvard Medical School, MA, USA) ,  DEKKER Job (Univ. Massachusetts Medical School, MA, USA)
資料名： Science  (Science)
巻： 326  号： 5950  ページ： 289-293  発行年： 2009年10月09日 
JST資料番号： E0078A  ISSN： 0036-8075  CODEN： SCIEA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 近隣DNA断片のライゲーションと大規模並行配列決定を結びつけることでゲノム全体の三次元構造を調べることができる新しい手法Hi-Cを確立した。正常な核型を持つリンパ芽球細胞株をHi-Cを用いて解析し,ヒトゲノムの相互作用地図を作成した。これにより,ゲノム全体では染色体領域と染色体の空間的近傍の2領域に,染色体規模では,クロマチンが解放と閉鎖の2つのコンパートメントからなることを確認できた。さらにメガベース規模ではクロマチンがフラクタル球の立体構造をとり,結び目がなく最大限密に詰め込まれている一方で,ゲノム全体で容易にフォールディングとアンフォールディングできると示唆した。

シソーラス用語： *ゲノム ,  *遠距離相互作用 ,  構造 ,  リンパ球 ,  芽細胞 ,  クロマチン ,  染色体 ,  折畳み構造 ,  細胞核 ,  常染色体
準シソーラス用語： *ヒトゲノム ,  三次元構造 ,  リンパ芽球 ,  染色体1 ,  *染色体マッピング

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： 長距離相互作用 ,  マッピング ,  ヒトゲノム ,  折りたたみ ,  原理