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J-GLOBAL ID：200902256917191065   整理番号：08A1171680

Phaeodactylumのゲノムから明らかになった珪藻ゲノムの進化の歴史

The Phaeodactylum genome reveals the evolutionary history of diatom genomes

著者 (39件)： BOWLER Chris (Ecole Normale Superieure, Paris, FRA) ,  BOWLER Chris (Stazione Zoologica ’Anton Dohrn’, Naples, ITA) ,  ALLEN Andrew E. (Ecole Normale Superieure, Paris, FRA) ,  ALLEN Andrew E. (J. Craig Venter Inst., California, USA) ,  BADGER Jonathan H. (J. Craig Venter Inst., California, USA) ,  GRIMWOOD Jane (Joint Genome Inst.-Stanford, Stanford Human Genome Center, California, USA) ,  JABBARI Kamel (Ecole Normale Superieure, Paris, FRA) ,  KUO Alan (Joint Genome Inst., California, USA) ,  MAHESWARI Uma (Ecole Normale Superieure, Paris, FRA) ,  MARTENS Cindy (Ghent Univ., Ghent, BEL) ,  MAUMUS Florian (Ecole Normale Superieure, Paris, FRA) ,  OTILLAR Robert P. (Joint Genome Inst., California, USA) ,  RAYKO Edda (Ecole Normale Superieure, Paris, FRA) ,  SALAMOV Asaf (Joint Genome Inst., California, USA) ,  VANDEPOELE Klaas (Ghent Univ., Ghent, BEL) ,  BESZTERI Bank (Alfred Wegener Inst. for Polar and Marine Res., Bremerhaven, DEU) ,  GRUBER Ansgar (Univ. Konstanz, Konstanz, DEU) ,  HEIJDE Marc (Ecole Normale Superieure, Paris, FRA) ,  KATINKA Michael (Inst. Genomique, CEA, Evry, FRA) ,  MOCK Thomas (Univ. Washington, Washington, USA) ,  VALENTIN Klaus (Alfred Wegener Inst. for Polar and Marine Res., Bremerhaven, DEU) ,  VERRET Frederic (Marine Biological Assoc. of the UK, Plymouth, GBR) ,  BERGES John A. (Univ. Wisconsin-Milwaukee, Wisconsin, USA) ,  BROWNLEE Colin (Marine Biological Assoc. of the UK, Plymouth, GBR) ,  CADORET Jean-Paul (IFREMER, Nantes, FRA) ,  CHIOVITTI Anthony (Univ. Melbourne, Victoria, AUS) ,  CHOI Chang Jae (Univ. Wisconsin-Milwaukee, Wisconsin, USA) ,  COESEL Sacha (Stazione Zoologica ’Anton Dohrn’, Naples, ITA) ,  DE MARTINO Alessandra (Ecole Normale Superieure, Paris, FRA) ,  DETTER J. Chris (Joint Genome Inst., California, USA) ,  DURKIN Colleen (Univ. Washington, Washington, USA) ,  FALCIATORE Angela (Stazione Zoologica ’Anton Dohrn’, Naples, ITA) ,  FOURNET Jerome (Univ. de Nantes, Nantes, FRA) ,  HARUTA Miyoshi (Univ. Wisconsin Biotechnology Center, Wisconsin, USA) ,  HUYSMAN Marie J. J. (Ghent Univ., Ghent, BEL) ,  JENKINS Bethany D. (Univ. Rhode Island, Rhode Island, USA) ,  JIROUTOVA Katerina (Univ. South Bohemia, Ceske Budejovice, CZE) ,  JORGENSEN Richard E. (Univ. Arizona, Arizona, USA) ,  JOUBERT Yolaine (Univ. de Nantes, Nantes, FRA)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 456  号： 7219  ページ： 239-244  発行年： 2008年11月13日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 珪藻類は,光合成能をもつ二次内部共生体で海洋環境と淡水環境にわたって広く分布し,地球の一次生産能力のおよそ5分の1を担っていると考えられている。海洋性の中心目珪藻Thalassiosira pseudonanaのゲノム塩基配列が最近報告され,珪藻に関するさまざまな生物学的情報が明らかになった。本論文では,羽状目の珪藻Phaeodactylum tricornutumのゲノムの完全塩基配列を報告し,これをT.pseudonanaと比較して,進化起源や機能的重要性,これらの性質の珪藻類全般にわたる普遍性を明らかにする。羽状目珪藻と中心目珪藻の系統は分離してからわずか9,000万年しか経っていないが,そのゲノム構造は著しく異なっており,2つの系統の代表格であるこの2つの珪藻ゲノムでは,遺伝子のかなりの割合(約40%)が共通ではない。酵母や後生動物の分子分岐との比較解析から,珪藻では遺伝子多様化の速度が非常に速いことがわかる。これに寄与する要因としては,遺伝子ファミリーの選択的拡大,遺伝子やイントロンの特異的な喪失,獲得,転移因子の特異的移動などが挙げられる。最も注目すべき事実として,細菌由来の遺伝子が数百個存在することが挙げられる。どちらの珪藻にもこのような遺伝子移動が300例以上見つかり,その起源が古いことを立証している。またその多くは,代謝産物の管理や環境シグナル感知の新しい能力をもたらしている可能性がある。これらの知見によって,現在の海洋における珪藻類の驚異的な多様性と繁栄の理由の解明が大きく進むだろう。Copyright Nature Publishing Group 2008

シソーラス用語： *Phaeodactylum ,  *ゲノム ,  生物進化 ,  系統発生 ,  系統樹 ,  遺伝子 ,  ヌクレオチド配列 ,  種差
準シソーラス用語： *Phaeodactylum tricornutum

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： Phaeodactylum ,  ゲノム ,  珪藻 ,  進化 ,  歴史