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J-GLOBAL ID：200902257122839470   整理番号：09A1223932

一塩基解像度のヒトDNAメチロームが示すエピゲノムにおける広範囲にわたる差異

Human DNA methylomes at base resolution show widespread epigenomic differences

著者 (23件)： LISTER Ryan (Salk Inst. for Biological Studies, California, USA) ,  PELIZZOLA Mattia (Salk Inst. for Biological Studies, California, USA) ,  DOWEN Robert H. (Salk Inst. for Biological Studies, California, USA) ,  HAWKINS R. David (Univ. California San Diego, California, USA) ,  HON Gary (Univ. California San Diego, California, USA) ,  TONTI-FILIPPINI Julian (Univ. Western Australia, Western Australia, AUS) ,  NERY Joseph R. (Salk Inst. for Biological Studies, California, USA) ,  LEE Leonard (Univ. California San Diego, California, USA) ,  YE Zhen (Univ. California San Diego, California, USA) ,  NGO Que-Minh (Univ. California San Diego, California, USA) ,  EDSALL Lee (Univ. California San Diego, California, USA) ,  ANTOSIEWICZ-BOURGET Jessica (Morgridge Inst. for Res., Wisconsin, USA) ,  ANTOSIEWICZ-BOURGET Jessica (Genome Center of Wisconsin, Wisconsin, USA) ,  STEWART Ron (Morgridge Inst. for Res., Wisconsin, USA) ,  STEWART Ron (Genome Center of Wisconsin, Wisconsin, USA) ,  RUOTTI Victor (Morgridge Inst. for Res., Wisconsin, USA) ,  RUOTTI Victor (Genome Center of Wisconsin, Wisconsin, USA) ,  MILLAR A. Harvey (Univ. Western Australia, Western Australia, AUS) ,  THOMSON James A. (Morgridge Inst. for Res., Wisconsin, USA) ,  THOMSON James A. (Genome Center of Wisconsin, Wisconsin, USA) ,  THOMSON James A. (Univ. Wisconsin-Madison, Wisconsin, USA) ,  REN Bing (Univ. California San Diego, California, USA) ,  ECKER Joseph R. (Salk Inst. for Biological Studies, California, USA)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 462  号： 7271  ページ： 315-322  発行年： 2009年11月19日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： DNAシトシンのメチル化は,ゲノム制御や発生,疾患などの細胞過程に必須の役割を担う主要なエピジェネティック修飾の1つである。今回我々は,ヒトの胚性幹細胞と胎児繊維芽細胞由来の,哺乳類ゲノムにおけるメチル化シトシンのゲノム規模での一塩基解像度地図を初めて作製し,トランスクリプトームのメッセンジャーRNAや低分子RNA要素,複数のヒストン修飾,およびいくつかの主要な制御調節因子のDNA-タンパク質相互作用部位の比較解析とともに示す。これらの2つのゲノム間では,シトシンメチル化の組成とパターン化に,広範囲にわたって差異が見つかった。胚性幹細胞で同定されたすべてのメチル化のうち約4分の1が非CG配列にあったことから,胚性幹細胞では,遺伝子調節へ作用を及ぼすのに異なるメチル化機構を用いている可能性が示唆される。非CG配列でのメチル化頻度は,遺伝子本体(コード領域)において高く,タンパク質結合部位やエンハンサー領域では低かった。非CGメチル化は胚性幹細胞の分化誘導に伴って消失し,誘導性多能性幹細胞では復元された。多能性と分化にかかわる遺伝子の近位にある数百のメチル化状態の異なる領域や,繊維芽細胞での低転写活性と関連したメチル化レベルの広域な低下も見いだされた。これらの基準エピゲノム情報は,ヒトの疾患や発生におけるこの主要なエピジェネティック修飾を探るうえで,今後の研究の基礎となるだろう。Copyright Nature Publishing Group 2009

シソーラス用語： ヒト ,  メチル化 ,  核酸塩基 ,  ES細胞 ,  線維芽細胞 ,  *トランスクリプトーム ,  *ゲノム ,  胎児 ,  ヌクレオチド配列 ,  DNA【核酸】 ,  窒素複素環化合物 ,  ウレア化合物 ,  DNAメチル化 ,  エピゲノム ,  遺伝子発現調整 ,  遺伝
準シソーラス用語： 遺伝的調節 ,  *メチローム

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

物質索引 (1件)： シトシン

タイトルに関連する用語 (6件)： 塩基 ,  解像度 ,  ヒト ,  DNA ,  エピゲノム ,  差異