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J-GLOBAL ID：200902259457103480   整理番号：09A1230124

非天然のイミダゾピリドピリミジン:ナフチリジン塩基対Deep Vent(exo^-)DNAポリメラーゼによる選択的取り込みと伸長反応

Unnatural imidazopyridopyrimidine:naphthyridine base pairs: selective incorporation and extension reaction by Deep Vent (exo^-) DNA polymerase

著者 (4件)： OGATA Shintaro (Hokkaido Univ., Sapporo, JPN) ,  TAKAHASHI Mayumi (Hokkaido Univ., Sapporo, JPN) ,  MINAKAWA Noriaki (Hokkaido Univ., Sapporo, JPN) ,  MATSUDA Akira (Hokkaido Univ., Sapporo, JPN)
資料名： Nucleic Acids Research  (Nucleic Acids Research)
巻： 37  号： 17  ページ： 5602-5609  発行年： 2009年 
JST資料番号： D0242C  ISSN： 0305-1048  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 非天然のイミダゾピリミジン:ナフチリジン(Im:Na)塩基対のImO^N:NaN^OおよびImN^O:NaO^Nのクレノウ断片exo^-[KF(exo^-)]による認識が報告されている。本研究では,ImN^O:NaO^N塩基対の酵素による認識の改善と,Deep Vent DNAポリメラーゼexo^-[Deep Vent(exo^-)]によるIm:Na塩基対後のプライマー伸長反応について検討した。KF(exo^-)はIm:Na塩基対後のプライマー伸長反応を触媒しなかったため,プライマー伸長反応の促進と塩基対認識の選択性の改善に関してDNAポリメラーゼの選別を行ったところ,Deep Vent(exo^-)がこの目的に最も有望と推定された。ImO^N:NaN^O塩基対ではテンプレート中におけるImO^Nに対するNaN^OTPの取り込みは天然のdNTPの取り込みより良好であったが,NaN^Oをテンプレート中に置いた場合はdGTPとdATPの取り込みはImO^NTPの取り込みと競合した。ImO^N:NaO^N塩基対の場合のDeep Vent(exo-)による塩基対認識の選択性は,KF(exo^-)による選択性よりも低いものであった。テンプレート中でのImN^Oに対するNaO^NTPの取り込みとNaO^Nに対するImN^OTPの取り込みは選択的であった。塩基対認識の選択性はImN^O:NaO^N塩基対中のDeep Vent(exo^-)により改善した。この酵素はImN^O:NaO^N塩基対の後にさらなるプライマー伸長反応を触媒し,忠実に複製できた。以上より,ImN^O:NaO^N塩基対はワトソン-クリック塩基対を越えた第三の塩基対である可能性が示された。

シソーラス用語： *DNAポリメラーゼ ,  MALDI-TOF MS ,  塩基対 ,  *DNA複製 ,  分子認識 ,  スクリーニング ,  酵素反応速度論 ,  忠実度 ,  飛行時間法
準シソーラス用語： イミダゾピリドピリミジン ,  ナフチリジン ,  *非天然ヌクレオチド ,  *Deep Vent DNAポリメラーゼ

分類 (2件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  核酸一般  (EB04010U)

タイトルに関連する用語 (4件)： 塩基対 ,  DNAポリメラーゼ ,  取り込み ,  伸長反応