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J-GLOBAL ID：200902276906811445   整理番号：08A1254750

MaxQuantは高いペプチド同定率,個別化されたppb範囲の質量精度,およびプロテオーム規模のタンパク質定量を可能にする

MaxQuant enables high peptide identification rates, individualized p.p.b.-range mass accuracies and proteome-wide protein quantification

著者 (2件)： COX Juergen (Max-Planck Inst. for Biochemistry, Martinsried, DEU) ,  MANN Matthias (Max-Planck Inst. for Biochemistry, Martinsried, DEU)
資料名： Nature Biotechnology  (Nature Biotechnology)
巻： 26  号： 12  ページ： 1367-1372  発行年： 2008年12月 
JST資料番号： H0870A  ISSN： 1087-0156  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ペプチド同定およびタンパク質定量用にきわめて大量の未処理データを効率よく解析することは,質量分析法(MS)によるプロテオミクスの主要な課題である。本論文で紹介するMaxQuantは,高分解能の定量的なMSデータ専用に開発された統合的なアルゴリズムのセットである。MaxQuantでは,相関解析およびグラフ理論を用いることにより,ピーク,同位体クラスター,および安定アミノ酸同位体標識(SILAC)ペプチド対が,m/z,溶出時間,およびシグナル強度の空間内で三次元的に検出される。複数の質量測定値を組み合わせて線型および非線型的な質量のずれを補正することにより,ppb範囲の質量精度が得られた。これは標準的な方法の6倍である。同位体と不完全切断状態の明確な割り当て,および個々の質量の精度により,SILACペプチド対は断片化スペクトルの同定率が73%に向上した。MaxQuantは,SILAC-プロテオーム実験1回当たり数十万個のペプチドを自動的に定量し,哺乳動物細胞溶解物中の4,000個を超えるタンパク質の統計的に確実性のある同定および定量を可能にする。Copyright Nature Publishing Group 2008

シソーラス用語： *質量分析 ,  *タンパク質 ,  *定量分析 ,  ペプチド ,  *計算機アルゴリズム ,  同定 ,  安定同位体 ,  標識法 ,  *アミノ酸 ,  質量 ,  HeLa細胞 ,  タンパク質加水分解物 ,  プロテオーム ,  *プロテオミクス
準シソーラス用語： *MaxQuant ,  細胞ライセート ,  生細胞 ,  同位体標識

分類 (3件)： 質量分析  (CC03013N) ,  分子構造  (EB03020Y) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (5件)： ペプチド同定 ,  質量 ,  プロテオーム ,  規模 ,  タンパク質定量