文献

J-GLOBAL ID：200902289145682519   整理番号：09A0265631

クロマチンのパターンから明らかになった,哺乳類で高度に保存された1,000個以上の大型非コードRNA

Chromatin signature reveals over a thousand highly conserved large non-coding RNAs in mammals

著者 (36件)： GUTTMAN Mitchell (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  GUTTMAN Mitchell (Massachusetts Inst. of Technol., Massachusetts, USA) ,  AMIT Ido (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  GARBER Manuel (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  FRENCH Courtney (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  LIN Michael F. (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  FELDSER David (Massachusetts Inst. of Technol., Massachusetts, USA) ,  HUARTE Maite (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  HUARTE Maite (Beth Israel Deaconess Medical Center, Massachusetts, USA) ,  ZUK Or (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  CAREY Bryce W. (Massachusetts Inst. of Technol., Massachusetts, USA) ,  CAREY Bryce W. (Whitehead Inst. for Biomedical Res., Massachusetts, USA) ,  CASSADY John P. (Massachusetts Inst. of Technol., Massachusetts, USA) ,  CASSADY John P. (Whitehead Inst. for Biomedical Res., Massachusetts, USA) ,  CABILI Moran N. (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  JAENISCH Rudolf (Massachusetts Inst. of Technol., Massachusetts, USA) ,  JAENISCH Rudolf (Whitehead Inst. for Biomedical Res., Massachusetts, USA) ,  MIKKELSEN Tarjei S. (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  MIKKELSEN Tarjei S. (Massachusetts Inst. of Technol., Massachusetts, USA) ,  JACKS Tyler (Massachusetts Inst. of Technol., Massachusetts, USA) ,  HACOHEN Nir (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  HACOHEN Nir (Massachusetts General Hospital, Massachusetts, USA) ,  BERNSTEIN Bradley E. (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  BERNSTEIN Bradley E. (Massachusetts General Hospital, Massachusetts, USA) ,  BERNSTEIN Bradley E. (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  KELLIS Manolis (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  KELLIS Manolis (Massachusetts Inst. of Technol., Massachusetts, USA) ,  REGEV Aviv (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  REGEV Aviv (Massachusetts Inst. of Technol., Massachusetts, USA) ,  RINN John L. (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  RINN John L. (Beth Israel Deaconess Medical Center, Massachusetts, USA) ,  RINN John L. (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  LANDER Eric S. (Broad Inst. of MIT and Harvard, Massachusetts, USA) ,  LANDER Eric S. (Massachusetts Inst. of Technol., Massachusetts, USA) ,  LANDER Eric S. (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  LANDER Eric S. (Whitehead Inst. for Biomedical Res., Massachusetts, USA)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 458  号： 7235  ページ： 223-227  発行年： 2009年03月12日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 哺乳類細胞が大型の遺伝子間転写産物を何千も作っていることが,次第にわかってきている。しかし,これらの転写産物の機能的重要性については,議論が盛んに行われている。詳しく解明されている例もいくつかあるが,大半(95%以上)は進化上保存されている証拠がほとんどなく,転写のノイズではないかとみられている。今回我々は,クロマチンの状態マップを用いる新しい方法で大型の非コードRNAを同定し,既知のタンパク質コード遺伝子座の間に,個別の転写単位が介在していることを見いだした。この方法により,4種類のマウス細胞で,約1,600個の複数のエキソンをもつ大型RNAを同定した。これまでの例とは対照的に,この大型介在性非コードRNA(lincRNA)は,そのゲノム遺伝子座,エキソン配列,プロモーター領域について強い純化選択を受けており,95%以上が明確な進化上の保存を示している。我々はさらに,lincRNAそれぞれの機能を推定する機能的ゲノム科学的手法を開発し,lincRNAが胚性幹細胞の多能性をはじめ,細胞増殖など幅広い過程でさまざまな役割を担うことを明らかにした。またこれとは独立に,細胞を用いた分析によって,100以上のlincRNAの推定機能を検証した。特に,特異的なlincRNAの転写が,p53,NFκB,Sox2,Oct4(Pou5f1ともよばれる),Nanogといった重要な転写因子によって,こうした過程で調節されていることも実証する。これらの結果によって,高度に保存され,さまざまな生物過程にかかわると考えられる,独特な機能性lincRNA群の存在が明らかになる。Copyright Nature Publishing Group 2009

シソーラス用語： クロマチン ,  *RNA【核酸】 ,  マウス ,  エキソン ,  転写【遺伝】 ,  転写因子 ,  遺伝的調節 ,  相同性
準シソーラス用語： *非コードRNA ,  *lincRNA

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： クロマチン ,  哺乳類 ,  保存 ,  大型 ,  非コードRNA