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J-GLOBAL ID：200902298439297493   整理番号：09A1236451

Escherichia coli B株REL606およびBL21(DE3)のゲノム配列

Genome Sequences of Escherichia coli B strains REL606 and BL21(DE3)

著者 (25件)： JEONG Haeyoung (Korea Res. Inst. of Bioscience and Biotechnology (KRIBB), 111 Gwahangno, Yuseong, Daejeon 305-806, KOR) ,  BARBE Valerie (CNRS UMR 8030, Genoscope (CEA), 2 rue Gaston Cremieux, CP 5706, 91000 Evry Cedex, FRA) ,  LEE Choong Hoon (Korea Res. Inst. of Bioscience and Biotechnology (KRIBB), 111 Gwahangno, Yuseong, Daejeon 305-806, KOR) ,  LEE Choong Hoon (Dep. of Biological Sciences, Korea Advanced Inst. of Sci. and Technol., Daejeon 305-701, KOR) ,  VALLENET David (CNRS UMR 8030, Genoscope (CEA), 2 rue Gaston Cremieux, CP 5706, 91000 Evry Cedex, FRA) ,  YU Dong Su (Korea Res. Inst. of Bioscience and Biotechnology (KRIBB), 111 Gwahangno, Yuseong, Daejeon 305-806, KOR) ,  CHOI Sang-haeng (Korea Res. Inst. of Bioscience and Biotechnology (KRIBB), 111 Gwahangno, Yuseong, Daejeon 305-806, KOR) ,  COULOUX Arnaud (CNRS UMR 8030, Genoscope (CEA), 2 rue Gaston Cremieux, CP 5706, 91000 Evry Cedex, FRA) ,  LEE Seung-won (Korea Res. Inst. of Bioscience and Biotechnology (KRIBB), 111 Gwahangno, Yuseong, Daejeon 305-806, KOR) ,  YOON Sung Ho (Korea Res. Inst. of Bioscience and Biotechnology (KRIBB), 111 Gwahangno, Yuseong, Daejeon 305-806, KOR) ,  CATTOLICO Laurence (CNRS UMR 8030, Genoscope (CEA), 2 rue Gaston Cremieux, CP 5706, 91000 Evry Cedex, FRA) ,  HUR Cheol-goo (Korea Res. Inst. of Bioscience and Biotechnology (KRIBB), 111 Gwahangno, Yuseong, Daejeon 305-806, KOR) ,  HUR Cheol-goo (Functional Genomics Program, Univ. of Sci. and Technol., Yuseong, Daejeon 305-333, KOR) ,  PARK Hong-seog (Korea Res. Inst. of Bioscience and Biotechnology (KRIBB), 111 Gwahangno, Yuseong, Daejeon 305-806, KOR) ,  PARK Hong-seog (Functional Genomics Program, Univ. of Sci. and Technol., Yuseong, Daejeon 305-333, KOR) ,  SEGURENS Beatrice (CNRS UMR 8030, Genoscope (CEA), 2 rue Gaston Cremieux, CP 5706, 91000 Evry Cedex, FRA) ,  KIM Sun Chang (Dep. of Biological Sciences, Korea Advanced Inst. of Sci. and Technol., Daejeon 305-701, KOR) ,  OH Tae Kwang (Korea Res. Inst. of Bioscience and Biotechnology (KRIBB), 111 Gwahangno, Yuseong, Daejeon 305-806, KOR) ,  OH Tae Kwang (21C Frontier Microbial Genomics and Applications Center, Yuseong, Daejeon 305-806, KOR) ,  LENSKI Richard E. (Dep. of Microbiology and Molecular Genetics, Michigan State Univ., East Lansing, MI 48824, USA) ,  STUDIER F. William (Biology Dep., Brookhaven National Lab., P.O. Box 5000, Upton, NY 11973-5000, USA) ,  DAEGELEN Patrick (CNRS UMR 8030, Genoscope (CEA), 2 rue Gaston Cremieux, CP 5706, 91000 Evry Cedex, FRA) ,  DAEGELEN Patrick (Inserm, 101 rue de Tolbiac, 75013 Paris, FRA) ,  KIM Jihyun F. (Korea Res. Inst. of Bioscience and Biotechnology (KRIBB), 111 Gwahangno, Yuseong, Daejeon 305-806, KOR) ,  KIM Jihyun F. (Functional Genomics Program, Univ. of Sci. and Technol., Yuseong, Daejeon 305-333, KOR)
資料名： Journal of Molecular Biology  (Journal of Molecular Biology)
巻： 394  号： 4  ページ： 644-652  発行年： 2009年12月11日 
JST資料番号： D0124B  ISSN： 0022-2836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 大腸菌K12およびBは,分子遺伝に関する我々の知識の多くが明らかとなった古典的実験の題材であった。今回,二種の大腸菌B株,長期の進化実験に使われたREL606および組換え蛋白質発現に広く使われたBL21(DE3)の全ゲノム配列を提示した。二つのゲノムは,この67年間で共通の祖先を有する実験室株としては大きな違いと考えられる,長さで72,304塩基対の違いがあり,426の一塩基対相違を有した。両系統でIS1およびIS150による遺伝子転位が生じた。BL21(DE3)へのDE3プロファージ組み込みはBのλ付着部位の欠損プロファージを追い出したと考えられる。長年のBとK12を比較した多くの遺伝的および生化学的実験から予想されたように,Bのゲノムは大きさおよび構成において大腸菌K12 MG1655のゲノムに類似し,それらのゲノムの約92%で>99%の配列同一性を示した。大腸菌BとK12はIS要素の分布およびより大きな可動要素の位置および組成においてかなり異なっていた。予想外の違いは,BでのIS1を介する41k塩基対の欠失による鞭毛遺伝子の大きなクラスターの欠如であった。LPSコア,O抗原および制限酵素を特定する遺伝子クラスターは大幅に異なり,水平伝播によると考えられた。片利共生および病原性の両方の性質を有する株である,32の独立して分離された大腸菌およびシゲラのゲノムの比較解析から,大きな大腸菌全ゲノムを構成する共通および多くの株特異的遺伝子における遺伝子の最小セットを同定した。Copyright 2009 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *大腸菌 ,  *ヌクレオチド配列 ,  分子遺伝現象 ,  不適正塩基対 ,  系統差 ,  挿入配列 ,  転位【遺伝】 ,  プロファージ ,  バクテリオファージ ,  組込【遺伝】 ,  λファージ ,  不完全ウイルス ,  相同性 ,  トランスポゾン ,  遺伝子欠損 ,  遺伝子 ,  リポ多糖類 ,  DNA制限酵素 ,  赤痢菌属 ,  遺伝子地図 ,  種差
準シソーラス用語： DE3ファージ ,  IS1 ,  IS150 ,  *ゲノム配列 ,  欠損ファージ ,  水平伝播 ,  大腸菌B ,  *大腸菌BL21(DE3) ,  大腸菌K12 ,  *大腸菌REL606 ,  蛋白質発現 ,  鞭毛遺伝子

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物の生化学  (EG03020N)

タイトルに関連する用語 (3件)： Escherichia ,  株 ,  ゲノム配列