ARE含有遺伝子の発現を同定および分析するための方法

発明者： , , ,
出願人/特許権者： ,
代理人 (3件)：山本秀策 , 安村高明 , 森下夏樹
公報種別：公表公報
出願番号（国際出願番号）：特願2001-580301
公開番号（公開出願番号）：特表2004-524801
出願日： 2001年04月12日
公開日（公表日）： 2004年08月19日
要約：

遺伝子およびmRNAの配列の3’非翻訳領域(UTR)に存在するアデニレート-ウリジレート-富化(ARE)エレメントが開示される。このAREモチーフは、さらなる制限とともに、配列番号1または配列番号2によって包含される配列を含む。AREエレメントを含むデータベース中の遺伝子またはコード配列を同定するコンピューターを用いる方法が開示される。このコンピューターを用いる方法は、遺伝子発見および配列分析に用いられ得る。PCR、RT-PCR、ハイブリダイゼーションなどを用いてAREエレメント関連ポリヌクレオチドを同定、単離、および増幅する方法が開示される。AREエレメントに関するPCRプライマー、オリゴヌクレオチドアレイ、ポリヌクレオチドライブラリー、コンピュータープログラム、およびコンピューターシステムが開示される。

請求項（抜粋）：

細胞における遺伝子発現を分析するために1セットの核酸を選択する方法であって、該方法は、以下: a)複数の核酸配列を含むデータベースを提供する工程であって、該核酸配列の各々が、タンパク質コード配列の全長または部分長、ならびに該タンパク質コード配列の下流に隣接している3’非翻訳領域配列を含む、工程; b)3’非翻訳領域(UTR)の上流に隣接して位置する1セットのタンパク質コード配列を同定することによって、該データベースから該タンパク質コード配列を抽出する工程であって、該3’非翻訳領域(UTR)が、以下の標的配列: i)第一標的配列WU/T(AU/TU/TU/TA)U/TWWWであって、ここでこの括弧の外側のヌクレオチドが、異なるヌクレオチドで置換されていないか、またはそのうち1つが異なるヌクレオチドで置換されており、ここでWがA,U、もしくはTを示す、第一標的配列;または ii)第二標的配列U/T(AU/TU/TU/T)nであって、ここでnは、該第二標的配列がこの括弧内の四量体配列のうち3〜12を含むことを示す、第二標的配列、の1つを含む、工程、を包含する、方法。

IPC (4件)：

C12N15/09 , C12M1/00 , C12M1/34 , C12Q1/68

FI (5件)：

C12N15/00 A , C12M1/00 A , C12M1/34 Z , C12Q1/68 A , C12N15/00 F

Fターム (22件)：

4B024AA11 , 4B024CA04 , 4B024CA09 , 4B024CA12 , 4B024HA14 , 4B024HA19 , 4B029AA07 , 4B029AA23 , 4B029CC03 , 4B029CC08 , 4B029FA15 , 4B063QA01 , 4B063QA18 , 4B063QQ42 , 4B063QQ53 , 4B063QR32 , 4B063QR55 , 4B063QR62 , 4B063QR82 , 4B063QS25 , 4B063QS34 , 4B063QS39

引用文献：

審査官引用 (5件)

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