特許
J-GLOBAL ID:200903002747600102
DNA分子索引法
発明者:
出願人/特許権者:
代理人 (1件):
平木 祐輔
公報種別:公開公報
出願番号(国際出願番号):特願平7-234122
公開番号(公開出願番号):特開平8-322598
出願日: 1995年09月12日
公開日(公表日): 1996年12月10日
要約:
【要約】 (修正有)【構成】 以下の工程:組織または細胞由来のRNAから逆転写したcDNAをClass IIS 制限酵素にて切断し、切断断片の付着末端に対応する配列を含むビオチニル化アダプターを上記cDNAにライゲートし、上記とは異なる制限酵素にてさらに上記cDNAを切断し、この異なる制限酵素をそれぞれ最初の切断に用いて、上述の操作を繰り返し、ストレプトアビジン被覆常磁気ビーズでライゲートサンプルを回収後、ライゲートサンプルよりビオチニル化アダプターに相補なオリゴヌクレオチドを除去し、上記cDNAをPCR法にて増幅し、増幅産物を変性ポリアクリルアミドゲル電気泳動によって分離し、断片のサイズを記録することを含むDNA分子索引法。【効果】 検体の細胞や組織に発現している遺伝子の分析パターンを正常な遺伝子の分析パターンと比較することにより、腫瘍などの変異を容易に正確かつ迅速に診断することができる。
請求項(抜粋):
以下の工程:(1) 組織または細胞由来のRNAから逆転写したcDNAをClass IIS 制限酵素にて切断し、(2) 切断断片の付着末端に対応する配列を含むビオチニル化アダプターを上記cDNAにライゲートし、(3) (1) で使用したものとは異なる他の2種のClass IIS 制限酵素にてさらに上記cDNAを切断し、(4) (3) の他の2種のClass IIS 制限酵素をそれぞれ最初の切断に用いて、(1) 〜(3) を繰り返し、(5) ストレプトアビジン被覆常磁気ビーズでライゲートサンプルを回収後、ライゲートサンプルよりビオチニル化アダプターに相補なオリゴヌクレオチドを除去し、(6) アダプター-プライマーとアンカーオリゴ(dT)プライマーとを用いて上記cDNAをPCR法にて増幅し、(7) 増幅産物を変性ポリアクリルアミドゲル電気泳動によって分離し、断片のサイズを記録することを含むDNA分子索引法。
IPC (4件):
C12Q 1/68
, C07H 21/02
, C07H 21/04
, C12N 15/09 ZNA
FI (4件):
C12Q 1/68 A
, C07H 21/02
, C07H 21/04 B
, C12N 15/00 ZNA A
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