特許
J-GLOBAL ID:200903004239345620

分子モデリングにおける解析的ヤコビアン計算のための方法

発明者:
出願人/特許権者:
代理人 (3件): 山本 秀策 ,  安村 高明 ,  森下 夏樹
公報種別:公表公報
出願番号(国際出願番号):特願2002-561758
公開番号(公開出願番号):特表2004-527027
出願日: 2001年11月02日
公開日(公表日): 2004年09月02日
要約:
物理系の動力学についての計算における陰的積分法で使用される解析的ヤコビアンを得る方法。この方法を用いて、数値的ヤコビアンの少なくとも2倍の有効桁数を有するヤコビアンが計算され得る。これはまた、運動方程式の非線形ステージ方程式を解くためにより少ない反復回数が必要とされるため、より効率的な陰的積分法を生じる。計算におけるスピードの向上は、分子モデリングにおいて非常に有用である。本発明はまた、ねじれ角、剛体多体系によってモデリングされ得る、分子の挙動、または任意の物理系をシミュレートするための、コンピュータコードを提供する。陰的積分器を使用する、コンピュータコードにおけるモジュールは、上記のような解析的ヤコビアンを含む。
請求項(抜粋):
分子の挙動をモデリングする方法であって、該方法は、以下: 該分子について、ねじれ角、剛体多体系モデルを選択する工程であって、該モデルが、運動方程式を有する、工程; 陰的積分器を選択する工程;および 解析的ヤコビアンを生成して、該陰的積分器が該運動方程式を積分して、該分子の挙動の計算を得る、工程、 を包含する、方法。
IPC (1件):
G06F19/00
FI (1件):
G06F19/00 110

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