特許
J-GLOBAL ID:200903007907855236

細菌同定のためのオリゴヌクレオチドおよびそれを用いた細菌の同定方法

発明者:
出願人/特許権者:
代理人 (1件): 久保田 藤郎 (外1名)
公報種別:公開公報
出願番号(国際出願番号):特願平9-317741
公開番号(公開出願番号):特開平11-137259
出願日: 1997年11月05日
公開日(公表日): 1999年05月25日
要約:
【要約】【課題】 簡便で、誤差も少なく、短時間に実施でき、しかも試験方法が統一された細菌の分離、同定法を開発すること。【解決手段】 配列表の配列番号1〜4に記載の塩基配列または該配列の1個もしくは数個の塩基が置換、付加もしくは欠失した塩基配列からなるオリゴヌクレオチド並びに被検菌より抽出したゲノムDNAを鋳型とし、請求項1記載のオリゴヌクレオチドおよび請求項2記載のオリゴヌクレオチドの組み合わせ(但し、配列表の配列番号1と3および配列番号4と2の組み合わせを除く)からなる1対のオリゴヌクレオチドをプライマーとして用いたポリメラーゼ連鎖反応法により細菌の16S-リボソームRNAをコードする遺伝子の5’末端領域のDNAの増幅を行い、得られた増幅産物の塩基配列を常法により決定し、該配列を既知のDNA塩基配列と比較し、被検菌が最も高い相同性を有する細菌種として同定することを特徴とする細菌の同定方法。
請求項(抜粋):
配列表の配列番号1または4に記載の塩基配列または該配列の1個もしくは数個の塩基が置換、付加もしくは欠失した塩基配列からなるオリゴヌクレオチド。
IPC (3件):
C12N 15/09 ZNA ,  C12Q 1/04 ,  C12Q 1/68
FI (3件):
C12N 15/00 ZNA A ,  C12Q 1/04 ,  C12Q 1/68 A

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