特許
J-GLOBAL ID:200903012534804125

生物学的データを評価するための方法、システム、および製品

発明者:
出願人/特許権者:
代理人 (3件): 山本 秀策 ,  安村 高明 ,  森下 夏樹
公報種別:公表公報
出願番号(国際出願番号):特願2002-513951
公開番号(公開出願番号):特表2004-516455
出願日: 2001年07月23日
公開日(公表日): 2004年06月03日
要約:
本発明に従った、方法、システム、および製品が、対立遺伝子コールを行うために提供される。特定の実施形態において、対立遺伝子コーリングは、いくつかの対立遺伝子コーリングアルゴリズムからコールを受信するコミッティマシンを提供することによって、達成される。複数の対立遺伝子コーリングアルゴリズムからのコールを受信することによって、このコミッティマシンは、種々の条件にわたって高い信頼水準を備えるコールを行う。特定の実施形態は、少なくとも二つのアルゴリズムおよび、少なくとも二つの対立遺伝子コーリングについての品質評価値を使用する方法を提供する。対立遺伝子コーリングのための独自の個々のアルゴリズムがまた、提供される。
請求項(抜粋):
対立遺伝子コールを行うためのコンピュータにより実行される方法であって、該方法は、以下: 核酸情報を表現するデータを受信する工程; 少なくとも二つの異なる対立遺伝子コーリングアルゴリズムを、該データに適用し、各アルゴリズムに対する結果を提供する工程;および 該アルゴリズム各々の結果間での一致に依存して、該データ内で対立遺伝子コールを同定し、そして各コールに対する信頼水準を割り当てる工程、 を包含する、方法。
IPC (6件):
G01N33/50 ,  C12N15/00 ,  C12Q1/68 ,  G01N33/48 ,  G06F17/10 ,  G06F17/17
FI (6件):
G01N33/50 P ,  C12Q1/68 Z ,  G01N33/48 Z ,  G06F17/10 Z ,  G06F17/17 ,  C12N15/00 Z
Fターム (9件):
2G045DA13 ,  2G045JA01 ,  4B063QA05 ,  4B063QA11 ,  4B063QQ43 ,  4B063QS39 ,  5B056BB71 ,  5B056BB72 ,  5B056BB74
引用文献:
審査官引用 (2件)
  • Bioinformatics Vol.15,No.9(1999)p.723-728
  • See-Kiong Ng「Automating Computational Molecular GeneticsSolving the Microsatellite Genotyping Probl

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