特許
J-GLOBAL ID:200903012534804125
生物学的データを評価するための方法、システム、および製品
発明者:
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出願人/特許権者:
代理人 (3件):
山本 秀策
, 安村 高明
, 森下 夏樹
公報種別:公表公報
出願番号(国際出願番号):特願2002-513951
公開番号(公開出願番号):特表2004-516455
出願日: 2001年07月23日
公開日(公表日): 2004年06月03日
要約:
本発明に従った、方法、システム、および製品が、対立遺伝子コールを行うために提供される。特定の実施形態において、対立遺伝子コーリングは、いくつかの対立遺伝子コーリングアルゴリズムからコールを受信するコミッティマシンを提供することによって、達成される。複数の対立遺伝子コーリングアルゴリズムからのコールを受信することによって、このコミッティマシンは、種々の条件にわたって高い信頼水準を備えるコールを行う。特定の実施形態は、少なくとも二つのアルゴリズムおよび、少なくとも二つの対立遺伝子コーリングについての品質評価値を使用する方法を提供する。対立遺伝子コーリングのための独自の個々のアルゴリズムがまた、提供される。
請求項(抜粋):
対立遺伝子コールを行うためのコンピュータにより実行される方法であって、該方法は、以下:
核酸情報を表現するデータを受信する工程;
少なくとも二つの異なる対立遺伝子コーリングアルゴリズムを、該データに適用し、各アルゴリズムに対する結果を提供する工程;および
該アルゴリズム各々の結果間での一致に依存して、該データ内で対立遺伝子コールを同定し、そして各コールに対する信頼水準を割り当てる工程、
を包含する、方法。
IPC (6件):
G01N33/50
, C12N15/00
, C12Q1/68
, G01N33/48
, G06F17/10
, G06F17/17
FI (6件):
G01N33/50 P
, C12Q1/68 Z
, G01N33/48 Z
, G06F17/10 Z
, G06F17/17
, C12N15/00 Z
Fターム (9件):
2G045DA13
, 2G045JA01
, 4B063QA05
, 4B063QA11
, 4B063QQ43
, 4B063QS39
, 5B056BB71
, 5B056BB72
, 5B056BB74
引用文献:
審査官引用 (2件)
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Bioinformatics Vol.15,No.9(1999)p.723-728
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See-Kiong Ng「Automating Computational Molecular GeneticsSolving the Microsatellite Genotyping Probl
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