特許
J-GLOBAL ID:200903028677458647

糖ペプチドの同定および解析

発明者:
出願人/特許権者:
代理人 (2件): 清水 初志 ,  新見 浩一
公報種別:公表公報
出願番号(国際出願番号):特願2006-500424
公開番号(公開出願番号):特表2006-518448
出願日: 2004年01月05日
公開日(公表日): 2006年08月10日
要約:
本明細書記載の本発明は、プロテオミクス質量分析(MS)データを解析して糖タンパク質を同定および特徴づけるために開発されたツールに関する。本ツールは、4つの主要な課題を独立してまたは必要に応じて行うように設計されている:MS/MSのための糖ペプチドの選択を至適化する、MS/MSデータから糖ペプチドスペクトルを同定する、同定された糖ペプチドスペクトルの糖成分を特徴づける、およびグリコシル化前駆体をその親タンパク質に一致させる。これらの成分のそれぞれに関する設計および実行について、本特許出願においてさらに詳細に説明する。
請求項(抜粋):
以下の段階を含む、質量分析検索スキャンデータでグリコフォームを決定する方法: a) 複数の生体分子を含む生物試料を提供する段階; b) 生体分子の複数のイオンを生成する段階; c) 複数のイオンに対して質量分析測定を行い、それにより生体分子のイオンカウントピークを得る段階;および d) 単糖の差によるグリコフォームのイオンカウントピークの分布を同定し、それにより生物試料中のグリコフォームの存在を決定する段階。
IPC (1件):
G01N 27/62
FI (3件):
G01N27/62 V ,  G01N27/62 X ,  G01N27/62 D
Fターム (14件):
2G041CA01 ,  2G041DA04 ,  2G041DA05 ,  2G041EA04 ,  2G041EA12 ,  2G041FA12 ,  2G041GA06 ,  2G041GA09 ,  2G041HA01 ,  2G041HA02 ,  2G041JA02 ,  2G041JA07 ,  2G041LA07 ,  2G045DA44

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