生物体のタイプを判別するためのマーカーの選択方法及び選択されたマーカーの利用

発明者： , , , ,
出願人/特許権者： , ,
代理人 (1件)：特許業務法人アイテック国際特許事務所
公報種別：公開公報
出願番号（国際出願番号）：特願2006-229798
公開番号（公開出願番号）：特開2008-048689
出願日： 2006年08月25日
公開日（公表日）： 2008年03月06日
要約：

【課題】染色体コピー数情報に基づいて生物体のタイプを判別する技術を提供する。【解決手段】生物体のタイプを染色体コピー数情報に基づいて判別するためのマーカーを選択するのにあたり、生物体についてタイプが既知である複数個体の染色体コピー数情報を準備し、生物体についてタイプが既知である複数個体の染色体コピー数情報に基づいてタイプを判別するためのマーカーを選択するようにする。マーカーの選択は、タイプが既知である複数個体の染色体コピー数情報に対して、複数個体から選択される一つの個体を判別対象とし、残余の個体を判別器とするLeave-one-out cross-validationを適用して得られる検証結果を利用する。【選択図】なし

請求項（抜粋）：

生物体が備える可能性のある少なくとも2種類のタイプを判別するためのマーカーの選択方法であって、前記タイプが既知である前記生物体の複数個体の複数種類のマーカー候補に関する染色体コピー数情報及び前記複数個体の前記マーカー候補毎のコピー数異常の有無に関するコピー数異常情報に基づいて、一つの前記マーカー候補につき前記複数個体においてコピー数異常が生じることについての統計的有意性が肯定的に判定されるときに当該マーカー候補を判別用マーカーとして選択する、選択方法。

IPC (4件)：

C12N 15/09 , G06F 19/00 , C12Q 1/68 , C12M 1/00

FI (4件)：

C12N15/00 A , G06F19/00 600 , C12Q1/68 A , C12M1/00 A

Fターム (25件)：

4B024AA11 , 4B024AA20 , 4B024CA01 , 4B024CA09 , 4B024CA11 , 4B024HA11 , 4B029AA07 , 4B029AA23 , 4B029BB20 , 4B029CC02 , 4B029CC03 , 4B029CC08 , 4B029FA15 , 4B063QA01 , 4B063QA13 , 4B063QA20 , 4B063QQ42 , 4B063QQ52 , 4B063QR32 , 4B063QR35 , 4B063QR55 , 4B063QR62 , 4B063QS25 , 4B063QS31 , 4B063QX01

引用文献：

審査官引用 (9件)

Blood, 2005, Vol.106, pp.1770-1777
Bioinformatiocs, 2005, Vol.21, No.22, pp.4084-4091
Proc. AMIA Symp., 2002, pp.7-11

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