臨床的に重要な真菌病原体を検出するための核酸プローブおよび方法

発明者： , , , , ,
出願人/特許権者： ,
代理人 (1件)：青山葆 (外1名)
公報種別：公表公報
出願番号（国際出願番号）：特願2001-500809
公開番号（公開出願番号）：特表2003-501049
出願日： 2000年05月24日
公開日（公表日）： 2003年01月14日
要約：

【要約】本発明は、臨床的に重要な真菌の検出および同定の分野に関する。より詳細には、本発明は、臨床試料中のCandida albicans,Candida parapsilosis、Candida tropicalis、Candida kefyr、Candida krusei、Candida glabrata、Candidadubliniensis、Aspergillus flavus、Aspergillus versicolor、Aspergillus nidulans、Aspergillus fumigatus、Cryptococcus neoformans および Pneumocystis cariniのごとき真菌種を検出するための、rDNAの内部転写スペーサー(Internal Transcribed Spacer)(ITS)領域に由来する種特異的プローブ、ならびに該プローブの使用方法に関する。

請求項（抜粋）：

試料中の真菌病原体種を検出し同定する方法であって、少なくとも下記工程を含む方法: (i)試料中に存在する可能性のある真菌病原体の核酸を遊離させ、単離し、そして/あるいは濃縮すること、 (ii)必要ならば、該核酸の内部転写スペーサー領域(ITS)を、少なくとも1の真菌ユニバーサルプライマーペアーを用いて増幅すること、 (iii)工程(i)または(ii)の核酸を、下記の種特異的プローブ: GTCTAAACTTACAACCAATT (配列番号: 1)、TGTCACACCAGATTATTACT (配列番号: 2)、TATCAACTTGTCACACCAGA (配列番号: 3)、GTAGGCCTTCTATATGGG (配列番号: 4)、TGCCAGAGATTAAACTCAAC (配列番号: 5)、GGTTATAACTAAACCAAACT (配列番号: 6)、TTTTCCCTATGAACTACTTC (配列番号: 7)、AGAGCTCGTCTCTCCAGT (配列番号: 8)、GGAATATAGCATATAGTCGA (配列番号: 9)、GAGCTCGGAGAGAGACATC (配列番号: 10)、TAGTGGTATAAGGCGGAGAT (配列番号: 11)、CTAAGGCGGTCTCTGGC (配列番号: 12)、GTTTTGTTCTGGACAAACTT (配列番号: 13)、CTTCTAAATGTAATGAATGT (配列番号: 14)、CATCTACACCTGTGAACTGT (配列番号: 15)、GGACAGTAGAGAATATTGG (配列番号: 16)、GGACTTGGATTTGGGTGT (配列番号: 17)、GTTTACTGTACCTTAGTTGCT (配列番号: 18)、CCGCCATTCATGGCC (配列番号: 19)、CGGGGGCTCTCAGCC (配列番号: 20)、CCTCTCGGGGGCGAGCC (配列番号: 21)、CCGAGTGCGGCTGCCTC (配列番号: 22)、CCGAGTGCGGGCTGC (配列番号: 23)、GAGCCTGAATACCAAATCAG (配列番号: 24)、GAGCCTGAATACAAATCAG (配列番号: 25)、GTTGATTATCGTAATCAGT (配列番号: 26)、GCGACACCCAACTTTATT (配列番号: 27)、ATGCTAGTCTGAAATTCAAAAG (配列番号: 28)、GGATTGGGCTTTGCAAATATT (配列番号: 29)、TTCGCTGGGAAAGAAGG (配列番号: 30)、GCTTGCCTCGCCAAAGGTG (配列番号: 31)、TAAATTGAATTTCAGTTTTAGAATT (配列番号: 32)、TTGTCACACCAGATTATTACTT (配列番号: 33)、GGTTTATCAACTTGTCACACCAGA (配列番号: 34)、GGTATCAACTTGTCACACCAGATT (配列番号: 35)、GGTTATAACTAAACCAAACTTTTT (配列番号: 36)、GGGAATATAGCATATAGTCGA (配列番号: 37)、GGTTTTGTTCTGGACAAACTT (配列番号: 38)、CATCTACACCTGTGAACTGTTT (配列番号: 39)、CCGACACCCAACTTTATTTTT (配列番号: 40)、GTTGATTATCGTAATCAGTT (配列番号: 41)、GAACTCTGTCTGATCTAGT (配列番号: 42)、GTCTGAATATAAAATCAGTCA (配列番号: 43)、あるいはヌクレオチド配列の5’および/または3’末端部分における、プローブの種特異的ハイブリダイゼーション挙動に影響しない1個または2個のヌクレオチドの欠失および/または付加により上記配列とは異なっている該プローブの変種、あるいはTがUにより置換されている該プローブのRNA同等物、あるいは該プローブの相補的核酸のうちの少なくとも1つにハイブリダイゼーションさせること、次いで (iv)工程(iii)で形成されたハイブリダイゼーション複合体を検出すること。

IPC (2件)：

C12N 15/09 ZNA , C12Q 1/68

FI (2件)：

C12Q 1/68 A , C12N 15/00 ZNA A

Fターム (13件)：

4B024AA11 , 4B024CA02 , 4B024CA09 , 4B024GA30 , 4B024HA14 , 4B063QA01 , 4B063QA18 , 4B063QQ07 , 4B063QR35 , 4B063QR55 , 4B063QR62 , 4B063QS25 , 4B063QS34

引用文献：

審査官引用 (2件)

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