遺伝子発現調節エレメントのハイスループットでの特徴付けのための機能性アレイ

発明者： , , ,
出願人/特許権者：
代理人 (3件)：山本秀策 , 安村高明 , 森下夏樹
公報種別：公表公報
出願番号（国際出願番号）：特願2008-545677
公開番号（公開出願番号）：特表2009-519710
出願日： 2006年12月08日
公開日（公表日）： 2009年05月21日
要約：

本発明は、生物のゲノム、特にヒトゲノム中の遺伝子発現調節エレメントの大規模な構造および機能の特徴づけのための組成物、キット、アセンブリ、ライブラリー、アレイ、および高処理方法を提供する。本発明の1つの態様では、各発現構築物が、レポーター配列の発現が核酸セグメントの転写調節下にあるように発現ベクター中のレポーター配列に作動可能に連結された核酸セグメント、ライブラリー中で変動し、多様度が少なくとも50である核酸セグメントを含む、発現構築物のアレイを提供する。核酸セグメントは、転写プロモーターなどの遺伝子発現調節エレメントの巨大なライブラリーであり得る。本発明は、個別化医療、薬理ゲノミクス、および多形性と表現型形質との相関関係などに広範で多様に適用することができる。

請求項（抜粋）：

発現構築物のライブラリーであって、該ライブラリーの各メンバーがゲノム由来の異なる核酸セグメントを含み、該セグメントが発現ベクター中の異種レポーター配列に作動可能に連結された転写調節配列を含み、その結果、該レポーター配列の発現が該転写調節配列の転写制御下にあり、 (a)該ライブラリーは、少なくとも50の異なる核酸セグメントという多様度を有し、 (b)各核酸セグメントは、該ゲノム中でcDNAとして発現される配列に天然では連結しており、 (c)該ライブラリー中の核酸セグメントの平均長が少なくとも600ヌクレオチドである、発現構築物のライブラリー。

IPC (6件)：

C12N 15/09 , C40B 40/08 , C40B 40/02 , C12M 1/00 , C12Q 1/02 , C12Q 1/68

FI (7件)：

C12N15/00 A , C40B40/08 , C40B40/02 , C12M1/00 A , C12Q1/02 , C12Q1/68 Z , C12Q1/68 A

Fターム (40件)：

4B024AA01 , 4B024AA11 , 4B024CA01 , 4B024CA11 , 4B024DA01 , 4B024DA02 , 4B024DA05 , 4B024DA11 , 4B024EA04 , 4B024FA02 , 4B024FA10 , 4B024GA11 , 4B024HA09 , 4B024HA14 , 4B029AA07 , 4B029AA08 , 4B029AA21 , 4B029AA23 , 4B029BB01 , 4B029BB20 , 4B029FA15 , 4B063QA18 , 4B063QQ05 , 4B063QQ13 , 4B063QQ42 , 4B063QR08 , 4B063QR14 , 4B063QR32 , 4B063QR56 , 4B063QR60 , 4B063QR62 , 4B063QR69 , 4B063QR74 , 4B063QR80 , 4B063QR84 , 4B063QS24 , 4B063QS25 , 4B063QS34 , 4B063QS36 , 4B063QX02

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