特許
J-GLOBAL ID：200903034152138838
遺伝子発現データの処理方法、および、処理プログラム
発明者：
出願人/特許権者：
代理人 (1件)：
吉田 聡
公報種別：再公表公報
出願番号（国際出願番号）：JP2005016927
公開番号（公開出願番号）：WO2006-030822
出願日： 2005年09月14日
公開日（公表日）： 2006年03月23日
要約：
適切にDNAチップのデータのムラを検出し、また、可能であればそのムラを補正する。DNAチップ上の遺伝子の発現量に基づき得られたアレイデータを処理して、解析可能なデータを取得する遺伝子発現データの処理方法において、DNAチップが複数の小領域に分割される。アレイデータを構成するデータ値は標準化され(ステップ300)、小領域ごとに、標準化されたデータ値の平均値或いは中央値の標準偏差が算出される(ステップ310)。次いで、標準偏差の増大に基づいて、DNAチップのデータにおけるムラの存在の有無が検出される(ステップ310)。
請求項（抜粋）：
DNAチップ上の遺伝子の発現量に基づき得られ、記憶装置に記憶されたアレイデータを処理して、解析可能なデータを取得する遺伝子発現データの処理方法であって、
前記アレイデータを構成するデータ値を標準化するステップと、
前記DNAチップを複数の小領域に分割したときの、当該小領域の情報を記憶装置に記憶するステップと、
前記小領域ごとに、当該小領域に含まれるアレイデータの標準化されたデータ値の代表値を算出するステップと、
前記代表値の分布の標準偏差を算出するステップと、
前記標準偏差の増大に基づいて、DNAチップのアレイデータにおけるムラの存在を検出するステップと、を備えたことを特徴とする遺伝子発現データの処理方法。
IPC (1件)：
FI (1件)：
Fターム (6件)：
4B024AA11
, 4B024AA19
, 4B024CA01
, 4B024HA12
, 4B029AA07
, 4B029FA12
