特許

J-GLOBAL ID：200903035482788177

系統発生的に関連のある配列のライブラリー

発明者： ブラジ グルツェゴルツ ,  オリベラ バルドメロ エム.
出願人/特許権者： コグネティックス インコーポレーティッド
代理人 (2件)： 清水 初志 ,  新見 浩一
公報種別：公表公報
出願番号（国際出願番号）：特願2006-515233
公開番号（公開出願番号）：特表2007-526221
出願日： 2004年06月04日
公開日（公表日）： 2007年09月13日
要約：

本発明は、系統発生的に関連のある配列のアッセイ法および可能な核酸またはアミノ酸配列の組み合わせのセットを作成する方法を含む。配列はアラインメントを作成するために解析され、系統発生的に関連のある配列のセットが選択される。選択された系統発生的に関連のある配列のアラインメントにおいて各位置を占めている観察される残基またはインデルが同定され、この情報が配列の組み合わせのセットを作成するために用いられ、ここで可能な配列の組み合わせ(核酸またはポリペプチド)であるこのセットは、各位置で同定された観察される残基またはインデルの集合から構成される。

請求項（抜粋）：

可能なアミノ酸配列の組み合わせのセットを作成する方法であって、以下の段階を含む方法: 系統発生的に関連のあるアミノ酸配列を選択する段階; 該系統発生的に関連のあるアミノ酸配列を整列させて、アラインメントを作成する段階; 該系統発生的に関連のある配列の該アラインメントにおいて各位置を占めている観察されるアミノ酸残基またはインデルを同定する段階;および 各位置において同定された観察されるアミノ酸残基またはインデルの集合から本質的になる可能なアミノ酸配列の組み合わせのセットを作成する段階。

IPC (15件)：

C40B 40/10 ,  C07K 14/435 ,  C12N 15/09 ,  C40B 20/02 ,  A61P 25/08 ,  A61P 25/00 ,  A61P 25/16 ,  A61P 25/14 ,  A61P 25/18 ,  A61P 25/04 ,  A61P 25/22 ,  A61P 25/24 ,  A61P 25/20 ,  A61P 43/00 ,  G06F 19/00

FI (15件)：

C40B40/10 ,  C07K14/435 ,  C12N15/00 A ,  C40B20/02 ,  A61P25/08 ,  A61P25/00 ,  A61P25/16 ,  A61P25/14 ,  A61P25/18 ,  A61P25/04 ,  A61P25/22 ,  A61P25/24 ,  A61P25/20 ,  A61P43/00 111 ,  G06F19/00 600

Fターム (38件)：

4B024AA01 ,  4B024AA11 ,  4B024BA80 ,  4B024CA02 ,  4B024CA07 ,  4B024DA06 ,  4B024EA03 ,  4B024GA11 ,  4B024HA11 ,  4C084AA01 ,  4C084AA02 ,  4C084AA07 ,  4C084BA01 ,  4C084BA08 ,  4C084BA18 ,  4C084BA19 ,  4C084CA47 ,  4C084NA14 ,  4C084ZA011 ,  4C084ZA021 ,  4C084ZA051 ,  4C084ZA061 ,  4C084ZA081 ,  4C084ZA121 ,  4C084ZA151 ,  4C084ZA181 ,  4C084ZC021 ,  4H045AA10 ,  4H045AA20 ,  4H045AA30 ,  4H045BA10 ,  4H045BA41 ,  4H045BA60 ,  4H045CA50 ,  4H045DA83 ,  4H045EA20 ,  4H045EA21 ,  4H045FA74