特許
J-GLOBAL ID:200903036575703640

メタボロームデータの解析方法および代謝関与マーカー

発明者:
出願人/特許権者:
代理人 (2件): 五十部 穣 ,  松尾 まゆみ
公報種別:公開公報
出願番号(国際出願番号):特願2007-227195
公開番号(公開出願番号):特開2009-057337
出願日: 2007年08月31日
公開日(公表日): 2009年03月19日
要約:
【課題】多数のメタボロームデータを同時に解析してデータマイニングを行う手段を提供する。【解決手段】代謝物のMS解析(蛋白質の質量分析)から得られるMSピークのデータを用いて機械学習法に適用する。詳しくは、複数の決定木の解から多数決を採択するランダム森を用いてメタボロームデータのマイニング方法およびそれらを実現する装置。【選択図】図1
請求項(抜粋):
下記(1)〜(7)の工程を含む代謝に関与するバイオマーカー選抜方法; (1)代謝物をMS解析にてマススペクトルの出現情報を取得する工程、 (2)前記マススペクトルの出現情報および、化合物情報を入力する工程、 (3)前記(2)で入力した情報から、分子量(m/z)、イオンの検出強度、化合物情報を数値化したデータのいずれか一つ以上を取得する工程 (4)下記(4a)〜(4c)のいずれか一つ以上にランダム森を適用する工程; (4a)前記(3)で取得した値、 (4b)前記(3)で取得した値をもとにランダム森に適用し構築した予測モデル、 (4c)前記(4b)取得した予測モデルおよび前記(4a)で取得した値 (5)前記(4)でランダム森に適用したマススペクトルの出現情報から共通規則に基づく分類条件を用いてクラス分類する工程 (6)前記(5)でクラス分類されたデータを多次元距離尺度表示で座標配置する工程、 (7)前記(1)〜(6)の解析方法を用いて化合物情報を分類する工程 (8)前記(7)で分類された化合物情報から代謝に関与する化合物を同定する工程
IPC (2件):
C40B 30/02 ,  G06F 19/00
FI (2件):
C40B30/02 ,  G06F19/00 600

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