特許
J-GLOBAL ID：200903042727293442
HLA型判別用データベース作成方法及びHLA型判別用データベース作成方法プログラムを記録した記憶媒体並びにHLA型判別方法
発明者：
出願人/特許権者：
代理人 (1件)：
喜多 俊文
公報種別：公開公報
出願番号（国際出願番号）：特願平8-347760
公開番号（公開出願番号）：特開平10-179188
出願日： 1996年12月26日
公開日（公表日）： 1998年07月07日
要約：
【要約】【課題】 HLA型判定法においてダイレクトシーケンスを利用する場合、既知のホモ接合の組み合わせからなるヘテロ複合体のデータベースを作成し、ホモロジー検索を行う事によって、ホモ接合、ヘテロ接合の型判定までを行い、正確なHLA の型判断を行う方法を提供する。【解決手段】 遺伝子データバンク中のヒトの主要組織適合性遺伝子複合体であるHLA 遺伝子、抗原遺伝子データベースの中のホモ接合性のデータベースを入手し、ホモ接合のデータの組み合わせをおこない、ヘテロ接合のデータを作り、当該データベースと検体より求まった塩基配列データをホモロジー検索することによってホモ接合のデータのみでなくへテロ複合体も含めてのHLA 型の判別を行う。
請求項（抜粋）：
抗原遺伝子データのホモ接合性のデータを抗原単位で並べ、始端および終端側の塩基配列において、決定されていない部分がないようにアミノ酸単位で、上記塩基配列が決定されていない最大の領域までをすべてのalleleについて同一場所を削除し、ヘテロ接合を作るために2つのデータを掛け合わせ、各々の塩基コードの違った部分はNC-ICBに従い1文字のコードに置き換えて1文字表現のヘテロ複合体のデータを作ることを特徴としたHLA型判別用データベース作成方法。
IPC (2件)：
FI (2件)：
C12Q 1/00 Z
, G06F 15/40 370 F
