特許
J-GLOBAL ID:200903043955696421
蛋白質立体構造データベース検索方法
発明者:
出願人/特許権者:
代理人 (1件):
清水 守 (外1名)
公報種別:公開公報
出願番号(国際出願番号):特願平10-032503
公開番号(公開出願番号):特開平11-232291
出願日: 1998年02月16日
公開日(公表日): 1999年08月27日
要約:
【要約】【課題】 蛋白質の立体構造という三次元情報を、周辺分布と呼ばれる一次元情報に変換し、それをダイナミック プログラミング アルゴリズムによって比較することにより、検出感度の向上と高速検索を実現できる距離マップの周辺分布を用いた蛋白質立体構造データベース検索方法を提供する。【解決手段】 蛋白質立体構造データベース検索方法において、蛋白質の三次元立体構造をセットする工程と、前記三次元立体構造に基づいて二次元の距離マップを構築する工程と、前記距離マップに基づいて一次元の周辺分布を構築する工程と、この一次元の周辺分布をダイナミック・プログラミング・アルゴリズムによって比較する工程とを施すようにしたものである。
請求項(抜粋):
(a)蛋白質の三次元立体構造をセットする工程と、(b)前記三次元立体構造に基づいて二次元の距離マップを構築する工程と、(c)前記距離マップに基づいて一次元の周辺分布を構築する工程と、(d)一次元の周辺分布をダイナミック・プログラミング・アルゴリズムによって比較する工程とを施すことを特徴とする蛋白質立体構造データベース検索方法。
IPC (2件):
FI (2件):
G06F 15/40 370 F
, C07K 1/00
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