個体識別方法、並びに個体識別検査のためのアレイ、装置及びシステム

発明者： ,
出願人/特許権者：
代理人 (8件)：鈴江武彦 , 河野哲 , 中村誠 , 蔵田昌俊 , 峰隆司 , 福原淑弘 , 村松貞男 , 橋本良郎
公報種別：公開公報
出願番号（国際出願番号）：特願2005-188452
公開番号（公開出願番号）：特開2007-006720
出願日： 2005年06月28日
公開日（公表日）： 2007年01月18日
要約：

【課題】個体の識別に有利な一塩基多型を選択することによって、簡便且つ迅速な個体識別を可能とする方法を提供する。【解決手段】(i)2塩基置換型の一塩基多型において、アレル頻度をX及びYとし、X+Y=1、Y≦Xとしたとき、0.5≦X≦0.7である; (ii)3塩基置換型の一塩基多型において、アレル頻度をX、Y及びZとし、X+Y+Z=1、Z≦Y≦Xとしたとき、1/3≦X 且つ (1-X)/2≦Y 且つ X+Y<1であって、(a) Y≦1/2・X 且つ X<2/3であるか又は(b) 1/2・X<Y 且つ XY<2/9である;及び (iii)4塩基置換型の一塩基多型において、アレル頻度をX、Y、Z及びWとし、X+Y+Z+W=1、W≦Z≦Y≦Xとしたとき、1/4≦X 且つ (1-X)/3≦Y 且つ X+Y<1であって、(a) Y≦1/2・X 且つ X<2/3であるか又は(b) 1/2・X<Y 且つ XY<2/9である;一塩基多型を選択し、個体識別検査に用いることからなる。【選択図】図1

請求項（抜粋）：

個体が有する核酸配列と、試料とする核酸配列との一致を判定する個体識別方法において、識別されるべき対象個体が属する集団に存在する一塩基多型群から、複数の一塩基多型を選択する工程と、前記対象個体が有する核酸配列、及び試料由来の核酸配列中の、前記選択された複数の一塩基多型における遺伝子型を決定して、それらを比較する工程とを具備し、前記選択する工程においては、下記(i)〜(iii)の条件の何れか一つを満たす一塩基多型を選択することを特徴とする、個体識別方法: (i)2塩基置換型の一塩基多型において、取り得る2つの塩基のそれぞれのアレル頻度をX及びYとし、X+Y=1、Y≦Xとしたとき、 0.5≦X≦0.7 である; (ii)3塩基置換型の一塩基多型において、取り得る3つの塩基のそれぞれのアレル頻度をX、Y及びZとし、X+Y+Z=1、Z≦Y≦Xとしたとき、 1/3≦X 且つ (1-X)/2≦Y 且つ X+Y<1であって、 (a) Y≦1/2・X 且つ X<2/3 であるか又は (b) 1/2・X<Y 且つ XY<2/9である;及び (iii)4塩基置換型の一塩基多型において、取り得る4つの塩基のそれぞれのアレル頻度をX、Y、Z及びWとし、X+Y+Z+W=1、W≦Z≦Y≦Xとしたとき、 1/4≦X 且つ (1-X)/3≦Y 且つ X+Y<1であって、 (a) Y≦1/2・X 且つ X<2/3 であるか又は (b) 1/2・X<Y 且つ XY<2/9である。

IPC (6件)：

C12Q 1/68 , C12M 1/00 , C12M 1/38 , G01N 33/53 , G01N 37/00 , C12N 15/09

FI (6件)：

C12Q1/68 A , C12M1/00 A , C12M1/38 Z , G01N33/53 M , G01N37/00 102 , C12N15/00 F

Fターム (36件)：

4B024AA11 , 4B024AA19 , 4B024CA04 , 4B024CA05 , 4B024CA06 , 4B024CA09 , 4B024HA08 , 4B024HA09 , 4B024HA12 , 4B024HA14 , 4B024HA19 , 4B029AA07 , 4B029AA12 , 4B029AA21 , 4B029AA23 , 4B029BB20 , 4B029CC03 , 4B029FA12 , 4B029FA15 , 4B063QA01 , 4B063QA12 , 4B063QA18 , 4B063QA20 , 4B063QQ42 , 4B063QQ53 , 4B063QR08 , 4B063QR32 , 4B063QR36 , 4B063QR42 , 4B063QR55 , 4B063QR82 , 4B063QS25 , 4B063QS34 , 4B063QS36 , 4B063QS39 , 4B063QX04

引用特許：

出願人引用 (1件)

DNAマイクロアレイを用いた検査方法
公報種別：公開公報出願番号：特願2003-029666 出願人：キヤノン株式会社

引用文献：

審査官引用 (6件)

Methods in Molecular Biology
International Congress Series
Forensic Science International

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