特許
J-GLOBAL ID：200903054238791110
RNA配列情報処理方法、プログラムおよび装置
発明者：
出願人/特許権者：
代理人 (3件)：
大野 聖二
, 森田 耕司
, 田中 玲子
公報種別：公開公報
出願番号（国際出願番号）：特願2004-096140
公開番号（公開出願番号）：特開2005-284595
出願日： 2004年03月29日
公開日（公表日）： 2005年10月13日
要約：
【課題】 元のRNA配列の2次構造を直接知ることなく、2次構造に関連したRNA配列の比較を好適に行う技術を提供する。 【解決手段】 RNA配列情報処理方法は、配列生成ステップと配列比較ステップを含む。配列生成ステップは、RNA配列またはRNAを含む生物学的配列情報から、RNA2次構造のステム領域の候補であるステム候補を抽出し、ステム候補の配列で構成されるステム候補配列情報を生成する。配列比較ステップは、複数のステム候補配列に対して、ステム候補を比較単位とする動的計画法を適用することにより、複数のステム候補配列を比較して、複数のステム候補配列の類似度を算出する。【選択図】 図15
請求項（抜粋）：
RNA配列またはRNAを含む生物学的配列情報から、RNA2次構造のステム領域の候補であるステム候補を抽出し、ステム候補の配列で構成されるステム候補配列情報を生成する配列生成ステップと、
複数のステム候補配列に対して、ステム候補を比較単位とする動的計画法を適用することにより、前記複数のステム候補配列を比較して、前記複数のステム候補配列の類似度を算出する配列比較ステップと、
を含むことを特徴とするRNA配列情報処理方法。
IPC (2件)：
FI (2件)：
G06F17/30 170F
, C12N15/00 Z
