特許
J-GLOBAL ID：200903055495892608
生物学的試料におけるアップレギュレーションおよびダウンレギュレーションされたタンパク質の特徴付けに対するプロテオーム解析
発明者：
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出願人/特許権者：
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代理人 (1件)：
山本 秀策
公報種別：公表公報
出願番号（国際出願番号）：特願平10-520234
公開番号（公開出願番号）：特表2001-503860
出願日： 1997年10月24日
公開日（公表日）： 2001年03月21日
要約：
【要約】異常または化合物処理した条件下のような、種々の条件下でアップまたはダウンレギュレートされるタンパク質を特徴づけるために、細胞プロテオームを分析するための方法およびコンピュータシステムが提供され、薬物スクリーニングおよび試験を含み、ならびにこのような方法またはコンピュータシステムを使用して特徴づけられるタンパク質およびコードするまたは相補的な核酸が提供される。
請求項（抜粋）：
アップレギュレートされるかまたはダウンレギュレートされるかのいずれかであって、そして影響を受けた細胞と影響を受けていない細胞とを区別する影響を受けたタンパク質、またはインビトロまたはインビボで処理されるかまたは病理学的に影響を受けているいずれかである影響を受けたタンパク質から分泌されたタンパク質の、定性的変化または定量的変化を同定または特徴づける方法であって、該細胞が、特定の細胞タイプの試料、細胞株、組織、または病理学的試料に由来し、該試料は、該影響を受けないかまたは影響を受けたタンパク質を含む2次元ゲル電気泳動(2DGE)ゲルを提供するために2DGEに供され、該方法が、 (1)少なくとも1つのタンパク質を含む該電気泳動ゲルの新しい画像を捕獲する工程であって、ここで、該新しい画像が、少なくとも1つのタンパク質に対応する多数の新しい画像スポットを含み、各新しい画像スポットが、積分した光学密度パーセント(IOD%)および位置を有する、工程;および (2)該新しい画像を分析するために使用されるマスター合成画像を生成する工程であって、ここで、該マスター合成画像が、多数のマスター混成スポットデータリストを含み、各マスター混成スポットデータリストが、少なくともIOD%および位置によって規定される、工程; (3)マスター混成スポットデータリストを生成する工程であって、ここで、該マスター混成スポットデータリストが、該多数のマスター混成スポットデータリストの各々の少なくとも位置、IOD%、スポット数、および飽和値を含む、工程、を包含し、ここで、該マスター混成スポットデータリストまたはマスター合成画像は、必要に応じて少なくとも1つの該タンパク質の少なくとも1つの特徴をさらに含み、該特徴が、pI、分子量、各スポットについての位置および定量的データについての信頼性係数、形状情報、局所的バックグラウンドレベル、アミノ酸配列、質量スペクトル、およびタンパク質修飾を含む群より選択される、を含む方法。
IPC (6件)：
G01N 27/447
, C07K 14/00
, C12M 1/00
, C12N 15/09
, C12Q 1/68
, G06T 7/00
G01N 27/26 315 H
, C07K 14/00
, C12M 1/00 A
, C12Q 1/68 A
, G01N 27/26 325 B
, C12N 15/00 A
, G06F 15/62 395
