特許

J-GLOBAL ID：200903062266540010

コンピュータを利用した生物学的配列の解析技術

発明者： テレサ・エー. ・ウェブスター ,  モリス・エス.・マクドナルド ,  マイケル・ピー.・ミットマン ,  デビット・ジェイ.・ロックハート ,  ミン-スー・ホー ,  デレク・バーンハート ,  ルイス・シー.・ジェボンス
出願人/特許権者： アフィメトリックス・インコーポレーテッド
代理人 (1件)： 五十嵐 孝雄 (外2名)
公報種別：公開公報
出願番号（国際出願番号）：特願平9-369833
公開番号（公開出願番号）：特開平10-272000
出願日： 1997年12月11日
公開日（公表日）： 1998年10月13日
要約：

【要約】【課題】 核酸のような生物学的配列を解析するためのコンピュータ支援技術を提供する。【解決手段】 コンピュータシステムは、核酸プローブと検体核酸配列との間のハイブリッド形成親和性を示すハイブリッド形成強度を解析して、検体配列における塩基を呼び出す(塩基コールを行う)。複数の塩基コールを組み合わせることにより、単一の塩基コールを形成する。また、コンピュータシステムは、ハイブリッド形成強度を解析することによって、遺伝子発現を監視したり、あるいは、基準からの遺伝子発現の変化を監視したりする。

請求項（抜粋）：

コンピュータシステムにおいて、検体の核酸配列を解析するための方法であって、前記検体の核酸配列の少なくとも一部分に沿った各塩基位置に対して、複数の塩基コールを入力する工程と、各塩基位置に対して、前記複数の塩基コールを解析して単一塩基コールを生成する工程と、前記検体の核酸配列の少なくとも一部分に沿った複数の塩基位置に対する複数の単一塩基コールであって、前記検体の核酸配列における特定の塩基位置に対する前記複数の塩基コールからそれぞれ導かれた単一塩基コールを表示する工程と、を備える方法。

IPC (4件)：

C12Q 1/68 ,  C12N 15/09 ,  G06F 17/30 ,  G01N 33/50

FI (4件)：

C12Q 1/68 A ,  G01N 33/50 P ,  C12N 15/00 A ,  G06F 15/40 370 F

引用文献：

審査官引用 (1件)

• Nat.Biotechnol.,Vol.14,No.13(Dec.1,1996)p.1675-1680