特許

J-GLOBAL ID：200903066427342502

微生物から二次代謝産物を同定するための方法、システム及び情報リポジトリ

発明者： ファーネット クリス エム ,  ムカルピン ジェイムス ビー ,  バックマン ブライアン オー ,  ザゾプロス エマヌエル ,  スタッファ アルフレド ,  シャオ ジージ ,  ウォン サイ マン ,  デジャルディンズ ニコラス
出願人/特許権者： エコピア バイオサイエンシーズ インク
代理人 (1件)： 廣田 雅紀
公報種別：公表公報
出願番号（国際出願番号）：特願2003-562325
公開番号（公開出願番号）：特表2005-514959
出願日： 2003年01月24日
公開日（公表日）： 2005年05月26日
要約：

本発明は、微生物内の標的遺伝子クラスタによって合成される二次代謝産物を同定するための方法及びシステムに関する。推定上の又は確認された機能は遺伝子クラスタ内の遺伝子によるものであり、かかる微生物由来の抽出物であって、遺伝子クラスタによって合成される二次代謝産物を含有すると考えられる抽出物が得られる。続いて、かかる抽出物の化学的特性、物理的特性又は生物学的特性について検討し、代謝物を同定し、選択的に単離する。また本発明は、遺伝子クラスタ情報が二次代謝産物生成データリンクする情報リポジトリを提供するものである。本発明はさらに、情報リポジトリにアクセスするためのグラフィカルユーザーインターフェース、及びメモリに格納されるデータ構造を有するデータを格納するためのメモリに関する。

請求項（抜粋）：

微生物のゲノムに含まれる標的遺伝子クラスターによって合成された二次代謝産物を同定する方法であって、 a)推定上の又は確認済みの機能が、遺伝子クラスター中の少なくとも1つの遺伝子領域に起因する、標的遺伝子クラスターを含む微生物を提供するステップ、 b)標的遺伝子クラスターによって合成された二次代謝産物を含む抽出物を、微生物から得るステップ、 c)抽出物中の代謝産物の化学的、物理的又は生物的特性を測定するステップ、及び d)ステップc)で測定された化学的、物理的又は生物的特性と、遺伝子クラスターに含まれる遺伝子に起因する標的遺伝子クラスターによって合成された二次代謝産物の推定上の又は確認済みの機能に基づいて予測される化学的、物理的又は生物的特性とを比較することによって、ステップc)の代謝産物から、標的遺伝子クラスターによって合成された二次代謝産物を同定するステップ、 を含む方法。

IPC (2件)：

C12Q1/02 ,  C12Q1/18

FI (2件)：

C12Q1/02 ,  C12Q1/18

Fターム (11件)：

4B063QA01 ,  4B063QA08 ,  4B063QA18 ,  4B063QQ79 ,  4B063QQ98 ,  4B063QR75 ,  4B063QR76 ,  4B063QR77 ,  4B063QS24 ,  4B063QS39 ,  4B063QX01

引用特許：

審査官引用 (2件)

• デ-タベ-ス移行システムおよびプログラム記憶媒体
  公報種別：公開公報   出願番号：特願平11-011581   出願人：富士通株式会社
• 分散システム制御方法及びその実施装置
  公報種別：公開公報   出願番号：特願平11-070623   出願人：株式会社日立製作所