特許
J-GLOBAL ID:200903070172443285

タンパク質同定方法

発明者:
出願人/特許権者:
代理人 (1件): 西澤 利夫
公報種別:公開公報
出願番号(国際出願番号):特願平9-253986
公開番号(公開出願番号):特開平11-094837
出願日: 1997年09月18日
公開日(公表日): 1999年04月09日
要約:
【要約】【課題】 細胞内の多くのタンパク質を簡便かつ高精度で同定することのできる方法を提供する。【解決手段】 タンパク質分解試薬による消化断片の質量実測値が既知である特定タンパク質群を検索リストとして未知タンパク質を同定する方法であって、(a)細胞から分離された未知タンパク質を、前記と同一のタンパク質分解試薬で消化して断片化し、(b)消化断片の各々の質量を測定し、(c)質量を測定した消化断片数(x)と、検索リスト中の各タンパク質の消化断片数(y)との間で質量値が一致した断片数(z)を計測し、(d)以下の一致率RF1およびRF2:RF1= z/xRF2= z/yを算出し、(e)RF1とRF2の各々が0.3以上であり、かつ最大である検索リスト中のタンパク質を、未知タンパク質と同一のタンパク質として同定する。
請求項(抜粋):
タンパク質分解試薬による消化断片の質量実測値が既知である特定タンパク質群を検索リストとして未知タンパク質を同定する方法であって、(a)細胞から分離された未知タンパク質を、前記と同一のタンパク質分解試薬で消化して断片化し、(b)消化断片の各々の質量を測定し、(c)質量を測定した消化断片数(x)と、検索リスト中の各タンパク質の消化断片数(y)との間で質量値が一致した断片数(z)を計測し、(d)以下の一致率RF1およびRF2:RF1= z/xRF2= z/yを算出し、(e)RF1とRF2の各々が0.3以上であり、かつ最大である検索リスト中のタンパク質を、未知タンパク質と同一のタンパク質として同定する、ことを特徴とするタンパク質同定方法。
IPC (2件):
G01N 33/68 ,  G01N 33/48
FI (2件):
G01N 33/68 ,  G01N 33/48 Z

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