特許
J-GLOBAL ID：200903077927401981

複数のアレル部位における増幅産物のゲノム型決定

発明者：
リヴァク ケニス ジェイ

リヴァク ケニス ジェイ について

, 
グッドサイド フェデリコ

グッドサイド フェデリコ について


出願人/特許権者：
ピーイー コーポレイション (エヌワイ)

ピーイー コーポレイション (エヌワイ) について


代理人 (1件)： 中村 稔 (外9名)
公報種別：公表公報
出願番号（国際出願番号）：特願2000-530635
公開番号（公開出願番号）：特表2002-502615
出願日： 1999年01月08日
公開日（公表日）： 2002年01月29日
要約：
【要約】5'ヌクレアーゼ増幅反応により少なくとも2つのアレル部位において標的配列のゲノム型を決定する方法が提供される。一つの実施態様では、本方法は少なくとも2つの異なるアレル部位を有する標的配列について、3'->5'ヌクレアーゼ活性を有する核酸ポリメラーゼおよび前記標的配列にハイブリダイズすることのできるプライマーを用いてアレルオリゴヌクレオチドプローブの2以上のセットの存在下で核酸増幅を行なうことであって、アレルオリゴヌクレオチドプローブの各セットは標的配列の異なるアレル部位を検出するためのものであり、アレルオリゴヌクレオチドプローブの各セットはこのプローブセットによって検出されるアレル部位における異なるアレル変異体に相補的である2以上のプローブを含み、このアレル部位はプライマーがハイブリダイズする標的配列の5'にあり、少なくとも、一つを除いて全てのアレルオリゴヌクレオチドプローブが他のプローブと異なる蛍光因子、および消光因子を有するものである、前記増幅を行なうこと;前記増幅の蛍光スペクトルを検出すること;前記蛍光スペクトルに対する各蛍光因子の寄与を計算すること;および、合成された蛍光スペクトルに対する各蛍光因子の蛍光寄与に基づいて、2以上の異なるアレル部位において異なるアレル変異体の存在又は不存在を決定すること、を含む。
請求項（抜粋）：
DNAサンプル中に、実質的に相同な配列の2以上のセットのどのメンバーが存在しているかを同定する方法であって、 実質的に相同な配列の第1のセット、および、実質的に相同な配列の第2の別のセットを含むDNAサンプルに対して、5'->3'ヌクレアーゼ活性を有する核酸ポリメラーゼおよび前記DNAサンプルにハイブリダイズすることのできるフォワードおよびリバースプライマーの1以上のセットを用いて、オリゴヌクレオチドプローブの2以上のセットの存在下で核酸増幅を行ない、実質的に相同な配列のセットの増幅を行なうことであって、 実質的に相同な配列の各セットが、互いに少なくとも1つの塩基位置で異なっている2以上のメンバーを含み、 前記オリゴヌクレオチドプローブの各セットが、実質的に相同な配列のセットの1つに属するメンバーを検出するためのものであり、 前記オリゴヌクレオチドプローブの各セットが、実質的に相同な配列のセットの異なるメンバーに相補的である2以上のプローブを含み、前記メンバーが前記プライマーのハイブリダイズするDNAサンプルの配列に対して5'にあり、 前記オリゴヌクレオチドプローブは、少なくとも、1つを除いて他のプローブと異なる蛍光因子、および前記蛍光因子の蛍光を消光するために前記プローブ上に設けられた消光因子を含むものである、前記増幅を行なうこと; 標的配列にハイブリダイズするこれらのオリゴヌクレオチドプローブをポリメラーゼのヌクレアーゼ活性によって増幅中に消化すること; 前記増幅の蛍光スペクトルを検出すること; 前記蛍光スペクトルに対する前記各蛍光因子の蛍光の寄与を計算すること;および、 前記蛍光スペクトルに対する前記各蛍光因子の寄与に基づいて、実質的に相同な配列の異なるメンバーが存在することまたは存在しないことを決定すること;を含む、前記方法。
IPC (6件)：
C12Q 1/68 ,  C12M 1/00 ,  C12M 1/00 ZNA ,  G01N 21/64 ,  G01N 33/53 ,  G01N 33/566
FI (7件)：
C12Q 1/68 A ,  C12M 1/00 A ,  C12M 1/00 ZNA A ,  G01N 21/64 F ,  G01N 21/64 Z ,  G01N 33/53 M ,  G01N 33/566
Fターム (28件)：
2G043AA03 ,  2G043CA04 ,  2G043EA01 ,  2G043EA13 ,  2G043FA03 ,  2G043GA07 ,  2G043GB07 ,  2G043GB21 ,  2G043LA01 ,  4B029AA23 ,  4B029BB20 ,  4B063QA13 ,  4B063QA18 ,  4B063QA19 ,  4B063QQ42 ,  4B063QR08 ,  4B063QR14 ,  4B063QR32 ,  4B063QR41 ,  4B063QR46 ,  4B063QR48 ,  4B063QR50 ,  4B063QR56 ,  4B063QR62 ,  4B063QR66 ,  4B063QS25 ,  4B063QS34 ,  4B063QX02
引用文献：
出願人引用 (5件)
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審査官引用 (5件)
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