特許

J-GLOBAL ID：200903079025838808

糖鎖断片化パターン解析装置および糖鎖断片化パターン解析方法

発明者： 福井 一彦 ,  高橋 勝利 ,  向井 有理 ,  亀山 昭彦 ,  成松 久
出願人/特許権者： 独立行政法人産業技術総合研究所
公報種別：公開公報
出願番号（国際出願番号）：特願2004-240845
公開番号（公開出願番号）：特開2006-058151
出願日： 2004年08月20日
公開日（公表日）： 2006年03月02日
要約：

【課題】イオン化された糖鎖の断片化パターンを解析するための糖鎖断片化パターン解析装置を提供する。【解決手段】糖鎖断片化パターン解析装置10は、イオン化された糖鎖の最適化構造を計算する最適化構造計算部22と、最適化構造計算部22による計算結果から、糖鎖内の切断箇所の候補となる複数の候補結合のそれぞれについて、結合強度に関連する複数種類の結合特性パラメータを抽出する結合特性パラメータ抽出部28と、結合特性パラメータ抽出部28にて抽出された複数種類の結合特性パラメータのそれぞれを結合特性スコアへと変換するパラメータ変換部34と、複数種類の結合特性スコアのそれぞれの結合強度に対する寄与を表す重み情報を記憶する重み情報記憶部38と、各候補結合における複数種類の結合特性スコアの総合スコアを、重み情報によって複数種類の結合特性パラメータが重み付けされるように求める総合スコア計算部36とを備える。【選択図】図3

請求項（抜粋）：

糖鎖マススペクトラのためにイオン化された糖鎖の断片化パターンを分子構造に基づく計算により解析するための糖鎖断片化パターン解析装置であって、 陽イオンの付加によりイオン化された糖鎖の最適化構造を計算する最適化構造計算手段と、 前記最適化構造計算手段による計算結果から、前記糖鎖内の切断箇所の候補となる複数の候補結合のそれぞれについて、結合強度に関連する複数種類の結合特性パラメータを抽出する結合特性パラメータ抽出手段と、 前記結合特性パラメータ抽出手段にて抽出された複数種類の結合特性パラメータのそれぞれを結合特性スコアへと、複数の候補結合における同一種類の結合特性パラメータの大小関係に結合特性スコアが対応するように変換するパラメータ変換手段と、 前記複数種類の結合特性パラメータに対応する複数種類の結合特性スコアのそれぞれの結合強度に対する寄与を表す重み情報を記憶する重み情報記憶手段と、 前記重み情報記憶手段から前記重み情報を読み出し、前記糖鎖の断片化パターンを表す情報として、各候補結合における複数種類の結合特性スコアの総合スコアを、読み出した重み情報によって前記複数種類の結合特性パラメータが重み付けされるように求める総合スコア計算手段と、 を備えることを特徴とする糖鎖断片化パターン解析装置。

IPC (1件)：

G01N 27/62

FI (2件)：

G01N27/62 V ,  G01N27/62 D

引用特許：

出願人引用 (4件)

• 化合物構造解析システム,質量分析データ解析方法,質量分析データ解析装置及び質量分析データ解析プログラム
  公報種別：公開公報   出願番号：特願2002-356120   出願人：株式会社日立製作所, 株式会社日立ハイテクノロジーズ
• 質量分析データの解析方法および質量分析データの解析装置および質量分析データの解析プログラムならびにソリューション提供システム
  公報種別：公開公報   出願番号：特願2002-185072   出願人：株式会社日立製作所
• ポリペプチドがエネルギーにより切断される部位を予測する方法
  公報種別：公開公報   出願番号：特願2002-153559   出願人：独立行政法人産業技術総合研究所
• 糖タンパク質構造解析手法
  公報種別：公開公報   出願番号：特願2004-119336   出願人：株式会社島津製作所, 大阪府

引用文献：

出願人引用 (1件)

• “糖鎖の分子計算によるMS断片化解析”