ゲノム解析からタンパク質の機能および相互作用を決定

発明者： , , , , ,
出願人/特許権者：
代理人 (1件)：大庭咲夫 (外2名)
公報種別：公表公報
出願番号（国際出願番号）：特願2000-596510
公開番号（公開出願番号）：特表2002-535972
出願日： 2000年01月28日
公開日（公表日）： 2002年10月29日
要約：

【要約】計算方法の体系およびコンピュータプログラムが、ゲノム配列から機能的リンクを推定するために提供される。1つの方法は、タンパク質A’およびB’のいくつかの対が単一のタンパク鎖ABに融合した別の有機体に相同物を有するという観測に基づく。配列のトランスゲノム比較は、A’およびB 間の相互作用を解読するロゼッタストーン配列であり、これらのAB配列を明らかにすることができる。別の方法は、2つ以上の有機体のゲノム配列を比較して、すべてのゲノムにわたってその有無を示す各タンパク質に対する系統分類プロファイルを創出する。そのプロファイルは、タンパク質の異なる系統間の機能的リンクに関する情報を提供する。更に別の方法では、上記の2つの方法の組合わせを用いて、機能的リンクを予測する。

請求項（抜粋）：

機能的にリンクされるように多数のポリペプチドを同定する方法であって: a)複数のタンパク質の一次アミノ酸配列に、多数の明らかに非相同であるポリペプチドの前記一次アミノ酸配列を整列させること;そして、 b)かかる多数の明らかに非相同であるポリペプチドすべての前記一次アミノ酸配列と、少なくとも1つのかかるタンパク質の前記一次アミノ酸配列との間に見られる任意のアラインメントに対して、前記少なくとも1つのかかるタンパク質を、前記多数のポリペプチド間の機能的リンクを示すものとして同定する指示を出力すること;を含む方法。

IPC (3件)：

C12N 15/09 , G01N 33/48 , G06F 17/30 170

FI (3件)：

G01N 33/48 Z , G06F 17/30 170 F , C12N 15/00 A

Fターム (15件)：

2G045DA12 , 2G045DA13 , 2G045DA14 , 2G045DA36 , 2G045JA01 , 4B024AA11 , 4B024AA20 , 4B024BA80 , 4B024CA01 , 4B024GA11 , 4B024HA01 , 4B024HA14 , 4B024HA19 , 5B075ND20 , 5B075UU19

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