特許

J-GLOBAL ID：200903080890181847

新規DNAポリメラーゼIIIホロ酵素デルタサブユニット核酸分子及び蛋白質

発明者： ブラード,ジェームズ・エム ,  ジャンジク,ネボジサ ,  マクヘンリー,チャールズ・エス
出願人/特許権者： レプリダイン・インコーポレーテッド
代理人 (5件)： 社本 一夫 ,  増井 忠弐 ,  小林 泰 ,  千葉 昭男 ,  富田 博行
公報種別：公表公報
出願番号（国際出願番号）：特願2002-512422
公開番号（公開出願番号）：特表2004-508018
出願日： 2001年07月16日
公開日（公表日）： 2004年03月18日
要約：

DNAポリメラーゼIIIホロ酵素δサブユニットをコードする遺伝子及びアミノ酸配列及び細菌由来の構造遺伝子が提供される。DNAポリメラーゼIIIδサブユニット分子を同定するのに有用な抗体及び他の試薬も提供される。DNAポリメラーゼIIIサブ有用分子を同定する方法も提供される。候補の抗生物質を同定するためのアッセイにおけるDNAポリメラーゼIIIδサブユニットの使用法も提供される。

請求項（抜粋）：

少なくとも一つの完全に配列決定されたゲノム由来の細菌のDNAポリメラーゼホロ酵素のδサブユニットを同定する方法であって、 a)多数の異なる生物に関する配列情報のデータベースを提供し; b)必要な反復の数を最小にするのに十分なレベルに包含の閾値(inclusion threshold)を設定し; c)検索される生物を選択するが、その際選択された生物が候補生物であり; d)基準生物からのδサブユニット蛋白質のアミノ酸配列を提供し; e)候補生物の配列と基準生物の配列を比較し; f)公知のDnaX蛋白質及び公知のδ’蛋白質を後続の工程から除外し; g)300から400のアミノ酸を含む蛋白質を選択し; h)候補生物からデルタ候補を選択するが、候補生物からのもっとも低いEスコアを用いて配列を選択することからなり;そして i)任意に工程e)-g)を繰り返えすことを含むが、その際、候補生物の配列は工程hにおいて選択された配列であり、但し、細菌のDNAポリメラーゼホロ酵素のδサブユニット蛋白質を同定してよい、方法。

IPC (16件)：

C12N15/09 ,  C07K16/40 ,  C12N1/15 ,  C12N1/19 ,  C12N1/21 ,  C12N5/10 ,  C12N9/10 ,  C12N15/02 ,  C12P21/08 ,  C12Q1/02 ,  C12Q1/48 ,  C12Q1/68 ,  G01N33/15 ,  G01N33/50 ,  G01N33/53 ,  G01N33/566

FI (17件)：

C12N15/00 A ,  C07K16/40 ,  C12N1/15 ,  C12N1/19 ,  C12N1/21 ,  C12N9/10 ,  C12P21/08 ,  C12Q1/02 ,  C12Q1/48 Z ,  C12Q1/68 A ,  G01N33/15 Z ,  G01N33/50 Z ,  G01N33/53 D ,  G01N33/53 M ,  G01N33/566 ,  C12N15/00 C ,  C12N5/00 A

Fターム (88件)：

2G045AA34 ,  2G045AA35 ,  2G045AA40 ,  2G045BA11 ,  2G045BB50 ,  2G045DA12 ,  2G045DA13 ,  2G045DA14 ,  2G045FB02 ,  4B024AA11 ,  4B024AA20 ,  4B024BA10 ,  4B024BA53 ,  4B024CA02 ,  4B024CA07 ,  4B024CA09 ,  4B024CA12 ,  4B024CA20 ,  4B024DA06 ,  4B024EA04 ,  4B024GA03 ,  4B024GA11 ,  4B024HA08 ,  4B024HA11 ,  4B024HA14 ,  4B024HA20 ,  4B050CC01 ,  4B050DD02 ,  4B050LL01 ,  4B050LL03 ,  4B050LL05 ,  4B063QA01 ,  4B063QA05 ,  4B063QA18 ,  4B063QQ21 ,  4B063QQ28 ,  4B063QQ41 ,  4B063QQ61 ,  4B063QQ89 ,  4B063QR08 ,  4B063QR32 ,  4B063QR35 ,  4B063QR39 ,  4B063QR42 ,  4B063QR48 ,  4B063QR55 ,  4B063QR62 ,  4B063QS31 ,  4B063QS33 ,  4B063QS34 ,  4B063QS39 ,  4B063QX02 ,  4B064AG27 ,  4B064CA10 ,  4B064CA20 ,  4B064CC01 ,  4B064CC24 ,  4B064DA01 ,  4B064DA13 ,  4B065AA01Y ,  4B065AA26X ,  4B065AA58X ,  4B065AA72X ,  4B065AA87X ,  4B065AB01 ,  4B065AC14 ,  4B065BA02 ,  4B065CA29 ,  4B065CA43 ,  4B065CA44 ,  4B065CA46 ,  4H045AA11 ,  4H045AA20 ,  4H045AA30 ,  4H045BA10 ,  4H045BA41 ,  4H045CA11 ,  4H045DA75 ,  4H045DA76 ,  4H045EA20 ,  4H045EA50 ,  4H045EA52 ,  4H045EA61 ,  4H045EA65 ,  4H045FA71 ,  4H045FA72 ,  4H045FA74 ,  4H045GA26

引用文献：

審査官引用 (1件)

• Nucleic Acids Research, 1997, Vol.25, No.17, p.3389-3402