ゲノムDNAの複雑性制御および分析

発明者： , ,
出願人/特許権者：
代理人 (1件)：山本秀策
公報種別：公表公報
出願番号（国際出願番号）：特願2000-578491
公開番号（公開出願番号）：特表2002-528096
出願日： 1999年10月27日
公開日（公表日）： 2002年09月03日
要約：

【要約】本発明は、核酸サンプルの複雑性を再現可能に減少する工程を包含する、サンプル調製および分析の新規な方法を提供する。本発明はさらに、例えば、多型性の存在または非存在のような特定の特徴について、所望のフラグメントをインターロゲートするように特異的に設計され得るアレイへのハイブリダイゼーションによって、上記のサンプルの分析を提供する。本発明はさらに、実際の実験を行う前に実験条件を決定するために、酵素反応をモデル化するコンピューターシステムを用いる新規な方法を提供する。

請求項（抜粋）：

第1の核酸サンプルを分析する方法であって、該方法は、以下: 該第1の核酸サンプルを提供する工程; 該第1の核酸サンプルの複雑性を再現可能に減少して、該第2の核酸サンプルが以下: 該第1の核酸サンプルをフラグメント化して、フラグメントを生成し、そしてアダプター配列を該フラグメントに連結する工程; 該第1の核酸サンプルをフラグメント化して、フラグメントを生成し、該フラグメントを変性し、いくつかの該フラグメントを、二本鎖DNA配列を形成するために再アニールし、そして該二本鎖DNA配列を除去する工程; 任意にプライムしたPCRにより増幅する工程; 該第1の核酸サンプルを、固体支持体に結合したオリゴヌクレオチドプローブにハイブリダイズさせる工程; 該第1の核酸配列を、ミスマッチ結合タンパク質にハイブリダイズさせる工程、により得られ得る、複数の非同一配列を含み得る第2の核酸サンプルを生成する工程; 核酸アレイを提供する工程; 該第2の核酸サンプルを、該アレイにハイブリダイズさせる工程;および該ハイブリダイゼーションの結果生じるハイブリダイゼーションパターンを分析する工程、を包含する、方法。

IPC (10件)：

C12N 15/09 ZNA , C12Q 1/68 , G01N 33/15 , G01N 33/50 , G01N 33/53 , G01N 33/543 541 , G01N 33/566 , G01N 33/58 , G01N 37/00 102 , G01N 37/00 103

FI (11件)：

C12Q 1/68 A , G01N 33/15 Z , G01N 33/50 T , G01N 33/50 Z , G01N 33/53 M , G01N 33/543 541 A , G01N 33/566 , G01N 33/58 A , G01N 37/00 102 , G01N 37/00 103 , C12N 15/00 ZNA F

Fターム (32件)：

2G045AA25 , 2G045BB24 , 2G045CB17 , 2G045CB20 , 2G045CB21 , 2G045CB26 , 2G045DA12 , 2G045DA13 , 2G045DA14 , 2G045FA36 , 2G045FB01 , 2G045FB02 , 2G045FB03 , 2G045FB05 , 2G045JA01 , 2G045JA20 , 4B024AA11 , 4B024CA01 , 4B024CA09 , 4B024HA14 , 4B024HA19 , 4B063QA01 , 4B063QA18 , 4B063QQ42 , 4B063QQ52 , 4B063QR14 , 4B063QR56 , 4B063QR62 , 4B063QR83 , 4B063QS25 , 4B063QS34 , 4B063QS39

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