研究者
J-GLOBAL ID:201001025273786718   更新日: 2024年11月14日

中村 保一

ナカムラ ヤスカズ | Yasukazu Nakamura
所属機関・部署:
職名: 教授
その他の所属(所属・部署名・職名) (2件):
  • 総合研究大学院大学  先端学術院 先端学術専攻 遺伝学コース   教授
  • かずさDNA研究所  ゲノム情報解析施設   特任研究員
ホームページURL (1件): http://ynlab.info/yn/
研究分野 (3件): 生命、健康、医療情報学 ,  獣医学 ,  ゲノム生物学
競争的資金等の研究課題 (20件):
  • 2022 - 2031 Bio-Digital Transformation (バイオDX)産学共創拠点
  • 2024 - 2028 アホロートル四肢再生における細胞分化リプログラミング機構の解明
  • 2023 - 2028 翻訳開始因子DAP5を軸とした腎糸球体障害の病態理解と応用
  • 2022 - 2028 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム
  • 2022 - 2025 ベンサミアナタバコのゲノム解析に基づく植物の接木分子基盤解明
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論文 (193件):
  • Ilene Karsch-Mizrachi, Masanori Arita, Tony Burdett, Guy Cochrane, Yasukazu Nakamura, Kim D Pruitt, Valerie A Schneider, On Behalf Of The International Nucleotide Sequence Database Collaboration. The international nucleotide sequence database collaboration (INSDC): enhancing global participation. Nucleic acids research. 2024
  • Yuki Matsumoto, Claire Yik-Lok Chung, Sachiko Isobe, Mika Sakamoto, Xiao Lin, Ting-Fung Chan, Hideki Hirakawa, Genki Ishihara, Hon-Ming Lam, Shinobu Nakayama, et al. Chromosome-scale assembly with improved annotation provides insights into breed-wide genomic structure and diversity in domestic cats. Journal of advanced research (pre-proof). 2024
  • Yuichi Kodama, Takeshi Ara, Asami Fukuda, Toshiaki Tokimatsu, Jun Mashima, Takehide Kosuge, Yasuhiro Tanizawa, Tomoya Tanjo, Osamu Ogasawara, Takatomo Fujisawa, et al. DDBJ update in 2024: the DDBJ Group Cloud service for sharing pre-publication data. Nucleic acids research. 2024
  • Mohamed Elmanzalawi, Takatomo Fujisawa, Hiroshi Mori, Yasukazu Nakamura, Yasuhiro Tanizawa. DFAST_QC: Quality Assessment and Taxonomic Identification Tool for Prokaryotic Genomes. biorxiv (preprint). 2024
  • Kazumichi Fujiwara, Atsushi Toyoda, Bhim B. Biswa, Takushi Kishida, Momi Tsuruta, Yasukazu Nakamura, Noriko Kimura, Shoko Kawamoto, Yutaka Sato, Toshio Katsuki, et al. Decoding the Centromeric Region with a Near Complete Genome Assembly of the Oshima Cherry Cerasus speciosa. bioRxiv (preprint). 2024
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MISC (276件):
  • 神川龍馬, 坂本美佳, 中村保一. ヒト以外の遺伝子に関連する研究 光合成能喪失によるゲノム進化:従属栄養性珪藻を例に. 遺伝子医学. 2024. 14. 2
  • 黒谷賢一, 平川英樹, 白澤健太, 田桐昂弥, 森萌恵, 市橋泰範, 鈴木孝征, 谷澤靖洋, 中村保一, 磯部祥子, et al. Nicotiana benthamianaゲノムとトランスクリプトームの包括的解析プラットフォームの構築. 日本植物生理学会年会(Web). 2024. 65th
  • 市原寿子, 山田学, 戸田陽介, 中谷明弘, 山下サマッチャヤー, 清水武彦, 白澤沙知子, 小原光代, 平川英樹, 中村保一, et al. 植物ゲノム情報ポータルサイト「Plant GARDEN」の改訂(2023年度・第4四半期版)-進化情報を活用するためのツールの開発-. 育種学研究. 2024. 26
  • 望月孝子, 坂本美佳, 谷澤靖洋, 中山卓郎, 谷藤吾朗, 神川龍馬, 中村保一. 様々なヘテロ接合性レベルを持つゲノムで検証された実用的なアセンブリガイドライン. 育種学研究. 2024. 26
  • 中村 保一. 非モデル生物のシークエンス解析・インフォマティクス解析. 植物科学の最前線. 2024. 15. B. 43-47
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講演・口頭発表等 (306件):
  • DDBJ and the INSDC: Shaping the Future of Global Genomic Data Infrastructure
    (11th International Conference on Biomedical and Bioinformatics Engineering (ICBBE 2024) 2024)
  • コンパニオン・アニマルのゲノム医療を目的としたネコとイヌの高精度リファレンスゲノム整備
    (かずさDNA研究所・Washoku BioGenome Consortium・PacBioジャパン・トミーデジタルバイオロジー 共催ウェビナーシリーズ 第4回:『多様な生物のゲノム解析の現状、解析手法の共有』 2024)
  • DDBJ updates in 2024
    (The 9th Big Data Forum for Life Health Sciences and the 21st Asian Bioinformatics Consortium Symposium 2024)
  • Comprehensive Annotation of Neuropeptides of <i>Gryllus bimaculatus</i>
    (International Congress of Entomology 2024)
  • A Chromosome-Scale Assembly of a Domestic Cat <i>Felis catus</i> of American Shorthair Breed
    (The 12th International Conference of Canine and Feline Genetics and Genomics 2024)
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学歴 (3件):
  • 1994 - 1996 総合研究大学院大学 大学院生命科学研究科 遺伝学専攻
  • 1989 - 1991 京都大学 大学院農学研究科 農芸化学専攻
  • 1985 - 1989 信州大学 農学部 農芸化学科
学位 (1件):
  • 博士(理学) (総合研究大学院大学)
経歴 (7件):
  • 2009/01 - 現在 かずさDNA研究所 特任研究員
  • 2009/01 - 現在 総合研究大学院大学 生命科学研究科 遺伝学専攻 教授
  • 2009/01 - 現在 国立遺伝学研究所 大量遺伝情報研究室 教授
  • 2006/04 - 2008/12 かずさDNA研究所 植物ゲノム情報研究室 室長
  • 2003/04 - 2008/12 東京大学 大学院新領域創成科学研究科 情報生命科学専攻 客員准教授
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委員歴 (7件):
  • 2024/05 - 現在 JSTさきがけ「時空間マルチスケール計測に基づく生物の復元あるいは多様化を実現する機構の解明」 領域アドバイザー
  • 2023/05 - 現在 The Genome Taxonomy Database (GTDB) Scientific Advisory Board member
  • 2021/12 - 現在 農研機構基盤技術セグメント検討会 外部レビュー委員
  • 2020/01 - 現在 China National Genomics Data Center's Scientific Advisory Board Scientific Advisor
  • 2019/04 - 現在 理化学研究所バイオリソース研究センター 情報検討委員会委員
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所属学会 (4件):
日本バイオインフォマティクス学会 ,  日本ゲノム微生物学会 ,  日本分子生物学会 ,  植物インフォマティクス研究会
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