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J-GLOBAL ID：201002207685525522   整理番号：09A1222494

土壌からのメタゲノミクスライブラリー構築およびイネイモチ病菌類(Magnaporthe grisea)に対する拮抗作用のあるクローンのスクリーニング

Construction of Metagenomic Library from Soil and Screening of Clones with Antagonism to the Rice Blast Fungus (Magnaporthe grisea)

著者 (5件)： CHEN Xuyu (Coll. of Environment and Plant Protection, Hainan Univ., Hainan, Danzhou) ,  ZHOU Yakui (Coll. of Environment and Plant Protection, Hainan Univ., Hainan, Danzhou) ,  YU Xianmei (Environment and Plant Protection Inst., Chinese Acad. of Tropical Agricultural Sci., Hainan, Danzhou) ,  LIN Chunhua (Coll. of Environment and Plant Protection, Hainan Univ., Hainan, Danzhou) ,  ZHENG Fucong (Coll. of Environment and Plant Protection, Hainan Univ., Hainan, Danzhou)
資料名： Xibei Nongye Xuebao  (Xibei Nongye Xuebao)
巻： 18  号： 1  ページ： 165-169  発行年： 2009年 
JST資料番号： C2199A  ISSN： 1004-1389  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： ゴム森林土壌からメタゲノミクスDNAを抽出し,ゲノムDNAを制限酵素pst Iで消化し,pBluescriptKS+ベクターに結合し,DH5中に転換し,約7 680のクローンを含むメタゲノミクスライブラリーを構築し,ここでクローン平均外部DNAフラグメントは4.3kbでライブラリー容量は32.25MBをカバーした。ライブラリーをスクリーニングし,はじめに配列スクリーニングし次に機能スクリーニング(再スクリーニング)から11クローンを選択し,結果は,JKDL-[1]; JKDL-2は顕著にMagnaporthe grisea,成長を阻害し,他の9つのクローンは活性がない。NCBI,におけるBlastx 分析からJKDL-[1]; JKDL-2はCaulobacter sp.K3[1]; Burkholderia ambifaria MC40-6と各75%,77%の相同性があり,これらの機能はGAF雑種センサヒスチジンキナーゼとアセチルCoAアセチルトランスフェラーゼと初期に推測された。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST

シソーラス用語： *遺伝子ライブラリー ,  ゲノム ,  森林土 ,  イネ ,  *いもち病 ,  *核菌類 ,  *拮抗作用 ,  スクリーニング ,  アセチルCoA C-アセチルトランスフェラーゼ ,  ヒスチジンキナーゼ ,  アミノ酸配列 ,  *クローン ,  *遺伝学 ,  ゴム ,  *土壌微生物
準シソーラス用語： *ゲノムライブラリー ,  *Magnaporthe grisea ,  メタゲノム ,  GAFドメイン ,  *メタゲノミクス

分類 (3件)： 土壌生物  (FB04050N) ,  微生物に対する農薬  (FB06040Q) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (10件)： 土壌 ,  メタゲノミクス ,  ライブラリー ,  構築 ,  イネイモチ病 ,  菌類 ,  Magnaporthe ,  拮抗作用 ,  クローン ,  スクリーニング