文献

J-GLOBAL ID：201002212460987130   整理番号：10A0469217

静電分極はアビジン-ビオチン結合の自由エネルギーに寄与する

Electrostatic Polarization Makes a Substantial Contribution to the Free Energy of Avidin-Biotin Binding

著者 (7件)： TONG Yan (East China Normal Univ., Shanghai, CHN) ,  TONG Yan (Henan Univ. Traditional Chinese Medicine, Zhengzhou, CHN) ,  MEI Ye (East China Normal Univ., Shanghai, CHN) ,  LI Yong L. (Nanjing Univ., Nanjing, CHN) ,  JI Chang G. (East China Normal Univ., Shanghai, CHN) ,  ZHANG John Z. H. (East China Normal Univ., Shanghai, CHN) ,  ZHANG John Z. H. (New York Univ., New York)
資料名： Journal of the American Chemical Society  (Journal of the American Chemical Society)
巻： 132  号： 14  ページ： 5137-5142  発行年： 2010年04月14日 
JST資料番号： C0254A  ISSN： 0002-7863  CODEN： JACSAT  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 分極した蛋白質-特異電荷を利用した分子動力学の計算機研究によってビオチン及び2′-イミノビオチンに対するアビジンの結合機構を解明した。蛋白質の分極は蛋白質-配位子の結合構造を正確に記述し,蛋白質の電子分極が結合部位におけるβシート(Thr113-Arg122)の安定化に重要な役割を果たすことが分かった。計算結果はビオチン及び2′-イミノビオチンとアビジンの結合自由エネルギーの差異がほぼ全てのアビジンとビオチンにおける水素結合の分極によって誘起された静電相互作用に基づくことを示した。アビジン-ビオチン結合における静電相互作用の欠落に関する従来の結論は蛋白質-配位子結合に分極効果を考慮しない非分極性力の場を適用した結果であった。

シソーラス用語： *誘電分極 ,  *自由エネルギー ,  *配位結合 ,  アビジン ,  ウレア化合物 ,  分子動力学 ,  計算化学 ,  結合部位 ,  安定化作用 ,  水素結合 ,  静電相互作用 ,  結合エネルギー ,  カルボン酸 ,  窒素複素環化合物 ,  補酵素 ,  硫黄複素環化合物 ,  ビタミンB群
準シソーラス用語： *電子分極

分類 (3件)： 分子の電気的・磁気的性質  (BH05032U) ,  化合物の化学熱力学(純物質)  (CB02023O) ,  分子の立体配置・配座  (BH05022J)

物質索引 (2件)： 2-イミノビオチン ,  ビオチン

タイトルに関連する用語 (4件)： 分極 ,  アビジン ,  ビオチン ,  自由エネルギー