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J-GLOBAL ID：201002215649998654   整理番号：10A0592843

シロイヌナズナ近交系における107の表現型の全ゲノム関連研究

Genome-wide association study of 107 phenotypes in Arabidopsis thaliana inbred lines

著者 (39件)： ATWELL Susanna (Univ. Southern California, California, USA) ,  HUANG Yu S. (Univ. Southern California, California, USA) ,  VILHJALMSSON Bjarni J. (Univ. Southern California, California, USA) ,  WILLEMS Glenda (Univ. Southern California, California, USA) ,  MENG Dazhe (Univ. Southern California, California, USA) ,  PLATT Alexander (Univ. Southern California, California, USA) ,  TARONE Aaron M. (Univ. Southern California, California, USA) ,  HU Tina T. (Univ. Southern California, California, USA) ,  JIANG Rong (Univ. Southern California, California, USA) ,  AMER Muhammad Ali (Univ. Southern California, California, USA) ,  TANG Chunlao (Univ. Southern California, California, USA) ,  NORDBORG Magnus (Univ. Southern California, California, USA) ,  MARJORAM Paul (Univ. Southern California, California, USA) ,  HORTON Matthew (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  LI Yan (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  MULIYATI N. Wayan (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  ZHANG Xu (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  KNISKERN Joel M. (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  ROUX Fabrice (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  TRAW M. Brian (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  BOREVITZ Justin O. (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  BERGELSON Joy (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  BAXTER Ivan (Purdue Univ., Indiana, USA) ,  SALT David E. (Purdue Univ., Indiana, USA) ,  BRACHI Benjamin (Univ. des Sci. et Technol. de Lille 1, Villeneuve d’Ascq, FRA) ,  FAURE Nathalie (Univ. des Sci. et Technol. de Lille 1, Villeneuve d’Ascq, FRA) ,  ROUX Fabrice (Univ. des Sci. et Technol. de Lille 1, Villeneuve d’Ascq, FRA) ,  CHORY Joanne (Howard Hughes Medical Inst., California, USA) ,  CHORY Joanne (Salk Inst. for Biological Studies, California, USA) ,  ECKER Joseph R. (Salk Inst. for Biological Studies, California, USA) ,  MICHAEL Todd (Salk Inst. for Biological Studies, California, USA) ,  DEAN Caroline (John Innes Centre, Norwich, GBR) ,  DEBIEU Marilyne (Max Planck Inst. for Plant Breeding Res., Cologne, DEU) ,  DE MEAUX Juliette (Max Planck Inst. for Plant Breeding Res., Cologne, DEU) ,  JONES Jonathan D. G. (Sainsbury Lab., Norwich, GBR) ,  NEMRI Adnane (Sainsbury Lab., Norwich, GBR) ,  TODESCO Marco (Max Planck Inst. for Developmental Biology, Tuebingen, DEU) ,  WEIGEL Detlef (Max Planck Inst. for Developmental Biology, Tuebingen, DEU) ,  NORDBORG Magnus (Gregor Mendel Inst., Vienna, AUT)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 465  号： 7298  ページ： 627-631  発行年： 2010年06月03日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 全ゲノム関連(Genome-wide association;GWA)研究は,一般的なヒト疾患の遺伝的基盤を見いだすという難題の解決策となる可能性があるため,ヒトを対象とする遺伝学者が先駆者となって開発されたが,遺伝子型や塩基配列を決定する技術が進歩したことで,農業で重要な自然変異や形質の遺伝学を研究するための方法として広く使われるようになっている。近交系が利用可能である場合には,GWA研究は特に有用である。なぜなら,これらの系統の遺伝子型が一度決定されれば,何回も表現型の決定ができるため,多くの異なる環境で多くの異なる形質を研究することが可能になる(また,非常に費用効率も高くなる)一方,表現型の測定を繰り返すことで,環境の影響を低減できるからである。本論文では,この方法の検出力を107の表現型についてGWA研究を行うことによって示す。研究対象としたシロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)は広く分布し,主に自家受精するモデル植物で,多くの重要な適応形質に対して,かなりの遺伝的多型をもつことが知られている。今回の結果はヒトのGWA研究の結果と大きく異なっているものだが,それは,我々のGWA研究では重要な効果をもつ多数の一般的な対立遺伝子が同定されたが,多くの場合,複雑な遺伝学的性質や集団構造による交絡のために偽りの関連と真の関連を区別することが難しく,それらの対立遺伝子の解釈がより難しくなっている点においてである。しかし,論理に基づいた候補はこれらの関連の中でも,かなり大きな比率を占めていることから,これらの多くが追試のための優れた候補になると考えられる。我々の研究で,シロイヌナズナでのGWA研究の実行可能性が示され,また,この方法がほかの多くの生物にも適していることが示唆される。Copyright Nature Publishing Group 2010

シソーラス用語： *Arabidopsis thaliana ,  *遺伝学実験技術 ,  表現型 ,  遺伝子多型 ,  対立遺伝子 ,  遺伝子型 ,  形質発現 ,  *ゲノムワイド関連解析
準シソーラス用語： *全ゲノム関連解析

分類 (1件)： 遺伝的変異  (EC01030Y)

タイトルに関連する用語 (5件)： シロイヌナズナ ,  近交系 ,  表現型 ,  ゲノム ,  研究