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J-GLOBAL ID：201002216306797463   整理番号：10A0750145

嫌気性成長条件下で誘導された大腸菌の新規の核様体蛋白質

A novel nucleoid protein of Escherichia coli induced under anaerobiotic growth conditions

著者 (4件)： TERAMOTO Jun (Hosei Univ., Tokyo) ,  YOSHIMURA Shige H. (Kyoto Univ., Kyoto, JPN) ,  TAKEYASU Kunio (Kyoto Univ., Kyoto, JPN) ,  ISHIHAMA Akira (Hosei Univ., Tokyo)
資料名： Nucleic Acids Research  (Nucleic Acids Research)
巻： 38  号： 11  ページ： 3605-3618  発行年： 2010年 
JST資料番号： D0242C  ISSN： 0305-1048  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ゲノムSELEXを用いて,大腸菌の転写因子YgipのDNA結合配列検索を行った。高密度マイクロアレイによるSELEXフラグメントの全ゲノムプロファイリング後,合計688のYgip結合遺伝子座を同定した。Ygipはコンセンサス配列GTTNATTを持つDNAプローブに沿って多重部位に結合することを,ゲルシフトおよびDNアーゼ1フットプリントアッセイが示した。低濃度でYgipはDNAプローブにおける種々の部位で会合するが,高濃度ではYgipはおそらく蛋白質-蛋白質接触を通じて蛋白質全体を覆うことを原子間力顕微鏡観察が示した。嫌気性条件下で成長する大腸菌におけるYgipの細胞内濃度は非常に低かったが,嫌気性条件下での主要な核様体蛋白質を100倍まで増加させた。Ygipを欠く大腸菌突然変異体は,嫌気性条件下で成長抑制を示した。Ygipは核様体蛋白質FisおよびIHFとして構造および調節的役割を持つ核様体関連蛋白質であることを,結合部位の高い豊度および数の多いことが示した。

シソーラス用語： *嫌気性 ,  *大腸菌 ,  *核様体 ,  *タンパク質 ,  成長 ,  ゲノム ,  遺伝学実験技術 ,  転写因子 ,  結合 ,  DNA【核酸】 ,  ヌクレオチド配列 ,  DNAマイクロアレイ ,  遺伝子座 ,  DNAプローブ ,  ゲル電気泳動 ,  DNアーゼ ,  エンドヌクレアーゼ ,  フットプリント法 ,  原子間力顕微鏡 ,  突然変異体 ,  結合部位
準シソーラス用語： SELEX ,  DNA結合 ,  DNA配列 ,  コンセンサス配列 ,  ゲルシフトアッセイ ,  DNアーゼ1

分類 (7件)： 微生物の生化学  (EG03020N) ,  生物学的機能  (EB03040U) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  酵素一般  (EB09010D) ,  生体の顕微鏡観察法  (EA03050C) ,  遺伝的変異  (EC01030Y)

タイトルに関連する用語 (6件)： 嫌気性 ,  成長条件 ,  誘導 ,  大腸菌 ,  核様体 ,  蛋白質