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J-GLOBAL ID：201002217859524763   整理番号：10A1619639

トマトにおける発生と非生物的ストレス処理時におけるERFファミリー遺伝子の同定,系統発生,転写プロファイリング

Identification, phylogeny, and transcript profiling of ERF family genes during development and abiotic stress treatments in tomato

著者 (6件)： SHARMA Manoj K. (Univ. Delhi (South Campus), New Delhi, IND) ,  KUMAR Rahul (Univ. Delhi (South Campus), New Delhi, IND) ,  SOLANKE Amolkumar U. (Univ. Delhi (South Campus), New Delhi, IND) ,  SHARMA Rita (Univ. Delhi (South Campus), New Delhi, IND) ,  TYAGI Akhilesh K. (Univ. Delhi (South Campus), New Delhi, IND) ,  SHARMA Arun K. (Univ. Delhi (South Campus), New Delhi, IND)
資料名： Molecular Genetics and Genomics  (Molecular Genetics and Genomics)
巻： 284  号： 6  ページ： 455-475  発行年： 2010年12月 
JST資料番号： C0025C  ISSN： 1617-4615  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： エチレン応答転写因子は植物発生,防御応答,ストレス情報伝達経路に関連し,これらのタンパク質を理解することは植物改良に有効である。本研究では様々な公共リポジトリ内の未加工ESTデータを利用し,トマトから85のERF遺伝子を同定した。系統発生解析から,モデル系で以前に同定された全グループ内でのトマトERFドメインの分布が明示された。MEMEモチーフ解析によりERFドメインに加え,各分岐群数に特性がある保存ドメインを同定した。QPCRとトマトGeneChipアレイを用いた栄養成長期と発生期の発現解析から,組織特異的/優先的蓄積を明らかにした。全ての内,57遺伝子がトマト果実発生期のある一定期間,差異的に発現していた。7つの非生物的ストレス処理に応じた,各分岐群を代表する23のERFファミリー遺伝子の発現解析により,それらは2つ以上のストレスに応じて差異的な発現をすることが分かった。以上の包括的データから導出されるゲノミクス研究により,植物発生とストレス応答時におけるERF遺伝子の役割が解決されることが示唆された。

シソーラス用語： *トマト ,  系統発生 ,  トランスクリプトーム ,  植物成長 ,  植物成長調整剤 ,  *転写因子 ,  果実【器官】 ,  ストレス ,  アミノ酸配列 ,  生体内蓄積 ,  遺伝子発現 ,  バイオチップ ,  アルケン
準シソーラス用語： *ERF ,  ジーンチップ ,  栄養成長 ,  非生物的ストレス

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  野菜  (FC03043X)

物質索引 (1件)： エチレン

タイトルに関連する用語 (7件)： トマト ,  非生物的ストレス ,  ファミリー ,  遺伝子 ,  同定 ,  系統発生 ,  転写プロファイリング