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J-GLOBAL ID：201002218235872968   整理番号：10A0428580

B-DNAの固有柔軟性:実験的TRX尺度

Intrinsic flexibility of B-DNA: the experimental TRX scale

著者 (7件)： HEDDI Brahim (INSERM, Paris) ,  HEDDI Brahim (IBPC, CNRS, Paris) ,  OGUEY Christophe (Univ. de Cergy-Pontoise, Cergy-Pontoise) ,  LAVELLE Christophe (IRI, CNRS, Villeneuve d’Ascq, FRA) ,  FOLOPPE Nicolas ,  HARTMANN Brigitte (INSERM, Paris) ,  HARTMANN Brigitte (IBPC, CNRS, Paris)
資料名： Nucleic Acids Research  (Nucleic Acids Research)
巻： 38  号： 3  ページ： 1034-1047  発行年： 2010年 
JST資料番号： D0242C  ISSN： 0305-1048  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： B-DNAの固有柔軟性はDNA-蛋白質認識に不可欠であり,その性状は配列に依存する。本論文は溶液におけるNMR³¹P化学シフトの大規模データセットに基づき,DNA固有柔軟性定量のためのTRX尺度に関する。このTRX尺度はDNAのBI⇔BII平衡を反映し,湾曲,巻き角と溝特徴のらせん状記述子と相関する。10個の相補性DNAジヌクレオチドを比較すると,柔軟性に差異があり,この適応性は一次的にはジヌクレオチドレベルで制御されテトラヌクレオチド環境で修正される。ヌクレオソーム形成をTRX尺度に供し,ある領域における柔軟性の周期的変動と,TRX尺度の蛋白質-DNA解析における有効性を示した。

シソーラス用語： B-DNA ,  *柔軟性 ,  分子認識 ,  化学平衡 ,  DNA【核酸】 ,  二重螺旋 ,  ジヌクレオチド ,  ヌクレオソーム ,  データベース ,  リン31NMR ,  *方法論 ,  *データ処理
準シソーラス用語： *TRX尺度 ,  湾曲DNA

分類 (1件)： 核酸一般  (EB04010U)

タイトルに関連する用語 (4件)： B-DNA ,  固有 ,  実験 ,  尺度